الملخص: الهدف: تمثل بقعة الخوخ البكتيرية، التي تسببها Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap)، تهديدًا كبيرًا لصناعة الخوخ العالمية. أشارت الدراسات إلى أن 41 سلالة من سلالات Xap المعزولة من أصناف مختلفة من الخوخ في الصين تظهر تمايزًا جينيًا معتدلًا، خصوصية واضحة لأصناف الخوخ، وتمايزًا جغرافيًا محدودًا. تم إيداع المعلومات الجينومية لـ 36 سلالة من Xap المعزولة من مناطق مختلفة في قاعدة بيانات الجينوم التابعة لـ NCBI؛ ومع ذلك، لا تزال تسلسلات الجينوم الكاملة لسلالات Xap المحددة في الصين غير متاحة. في هذه الدراسة، تم تجميع وتعليق الجينوم الكامل لسلالة Xap 9-4، المعزولة من أوراق الخوخ المريضة في الصين. وصف البيانات: تم تسلسل بيانات الجينوم لسلالة Xap 9-4 باستخدام منصتي إلومينا وباكبايو. يتكون جينوم Xap 9-4 من كروموسوم دائري يبلغ طوله 5,174,371 زوجًا قاعديًا وبلازميد دائري يبلغ طوله 41,329 زوجًا قاعديًا، مشفرًا 4,660 جينًا مشفرًا للبروتين، و201 ncRNA، و643 منطقة تكرارية و7 بروفيروسات. تم تعليق حوالي 94.82% من البروتينات. ستوسع هذه الاكتشافات الموارد الجينومية لـ Xap وتوفر أساسًا لمزيد من الدراسات حول التنوع الجيني وآليات تفاعل العوامل الممرضة والموائل.
درس يوان وزملاؤه (الجمعة) هذا السؤال.