الاقتران هو أداة كيميائية معلوماتية تعتمد على الهيكل تستخدم على نطاق واسع في اكتشاف الأدوية المبكر. استنادًا إلى الهيكل ثلاثي الأبعاد للبروتين المستهدف، يتم استخدام الاقتران للتنبؤ بالتفاعلات بين البروتين والربائط، وتقدير تقارب الربط المقابل، أو إجراء مسح افتراضي (VSs) لتحديد مركبات نشطة جديدة. يقدم هذه الدراسة مؤشر عامل B للربائط (LBI)، وهو مقياس حاسوبي جديد لتحديد أولويات المركبات البروتينية-الربائطية للاقتراص. على عكس المقاييس الأخرى، يقارن LBI مباشرة إزاحات الذرات في الربائط وموقع الربط. يتم تعريف LBI كنسبة الوسيط لعامل B الذري لموقع الربط إلى ذلك المرتبط بالربائط. باستخدام مجموعة بيانات التقييم المقارن لوظائف التقييم (CASF-2016)، قمنا بتقييم فعالية LBI في توجيه اختيار المركبات البروتينية-الربائطية لتعزيز أداء الاقتران. تظهر نتائجنا ارتباطًا معتدلاً (Spearman ρ ~ 0.48) بين LBI وتقاربات الربط التجريبية، متفوقًا على العديد من وظائف التقويم للاقتراح. بالإضافة إلى ذلك، يرتبط LBI مع تحسين نجاح إعادة الاقتران (الانحراف المعياري الجذري < 2 Å)، مما يبرز أهمية مقياس يركز على الربائط. بينما يتفوق LBI على مقاييس أخرى مثل مؤشر عامل B للبروتين والدقة، لا تزال فاعليته في الاقترانات الافتراضية بحاجة إلى مزيد من التحقيق. LBI سهل الحساب، قابل للتفسير، قابل للتطبيق في الكيمياء المعلوماتية المعتمدة على الهيكل، ومتاح مجانًا للحساب على https://chembioinf.ro/tool‐bi‐computing.html.
درس هالب وآخرون (Mon,) هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: