Key points are not available for this paper at this time.
فيروس إنفلونزا الطيور (AIV) يشكل تهديدًا كبيرًا لصناعة الدواجن، مما يتطلب تشخيصًا سريعًا ودقيقًا. تعتمد عملية التشخيص الحالية لفيروس AIV على تحديد الفيروس عبر تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل العكسي في الوقت الحقيقي (rRT-PCR). بعد ذلك، يتم تمييز الفيروس أكثر باستخدام تسلسل الجينوم. تستغرق هذه العملية التشخيصية ذات الخطوتين أيامًا إلى أسابيع، ولكن يمكن تسريعها باستخدام تقنيات التسلسل الحديثة. نحن نسعى إلى تحسين وتأكيد استخراج الحمض النووي كخطوة أولى لترسيخ تقنيات أكسفورد نانوبور (ONT) كأداة تشخيصية سريعة لتحديد وتمييز AIV من العينات السريرية. قارن هذه الدراسة بين أربعة بروتوكولات متاحة تجاريًا لاستخراج RNA باستخدام عينات سريرية معروفة إيجابية لـ AIV. تم تقييم RNA المستخرج باستخدام تركيز RNA الكلي، ونسخ الفيروس كما تم قياسه بواسطة rRT-PCR، والنقاء كما تم قياسه بواسطة نسبة امتصاص 260/280. بعد اختبار NGS، تم تقييم عدد القراءات الإجمالية وقراءات الإنفلونزا الخاصة وجودة التسلسلات الناتجة. أظهرت النتائج أنه لا يوجد بروتوكول تفوق على الآخرين في جميع المعايير المقاسة؛ ومع ذلك، كانت الطريقة المعتمدة على الجسيمات المغناطيسية هي الأكثر اتساقًا من حيث قيمة CT، والنقاء، والعائد الكلي، وقراءات AIV، وكانت أقل عرضة للأخطاء. تسلط هذه الدراسة الضوء على كيفية تأثير بروتوكولات استخراج RNA المختلفة على أداء تسلسل ONT.
دراسة تشافيز وآخرون (السبت) هذا السؤال.