Key points are not available for this paper at this time.
المستقلبات الثانوية هي مركبات ليست ضرورية لتطور الكائن الحي، ولكنها توفر فوائد بيئية وفسيولوجية كبيرة. هذه المركبات لها تطبيقات في الطب، والتكنولوجيا الحيوية، والزراعة. يتم ترميز إنتاجها في مجموعات الجينات البيوسنتتية (BGCs)، وهي مجموعات من الجينات التي توجه مجتمعة تخليقها الحيوي. لقد سمح ظهور علم الميتاجينومics للباحثين بدراسة BGCs مباشرة من عينات بيئية، مما أسفر عن تحديد العديد من BGCs غير المعروفة مسبقًا التي تشفر كيمياء غير مسبوقة. هنا، نقدم أطلس BGC (bgc-atlas.cs.uni-tuebingen.de)، وهو مورد ويب يسهل استكشاف وتحليل تنوع BGC في الميتاجينومات. يحدد أطلس BGC ويجمع BGCs من قواعد بيانات متاحة للجمهور، مما يوفر قاعدة بيانات مركزية وواجهة ويب لاستكشاف منهاج البيانات لمدخلات BGCs وعائلات مجموعات الجينات (GCFs). لقد حللنا أكثر من 35,000 مجموعة بيانات من MGnify، وحددنا ما يقرب من 1.8 مليون BGCs، والتي تم تجميعها في GCFs. أظهر التحليل أن الببتيدات الناتجة عن التخليق الريبوسومي والمعدلة بعد الترجمة (RiPPs) هي الأكثر وفرة بين فئات المركبات، مع وجود معظم GCFs ذات طابع بيئي عالٍ. نحن نعتقد أن أداتنا ستمكن الباحثين من استكشاف وتحليل تنوع BGC بسهولة في العينات البيئية، مما يعزز بشكل كبير فهمنا للمستقلبات الثانوية البكتيرية، ويعزز تحديد العوامل البيئية والتطورية التي تشكل الإمكانات البيوسنتتية للمجتمعات الميكروبية.
درس Bağcı et al. (جمعة) هذا السؤال.