تحليل شامل ومتكامل لتسلسل الحمض النووي الريبي للخلايا المفردة حول انتشار أورام الدماغ وبيئة الورم: تباين المناظر المتغيرة

يمكن أن يساعد فهم نوع الخباثة الدماغية المحددة، ومصدر انتشار أورام الدماغ، وآليات التحول الكامنة في تقديم علاج أفضل وتقليل الأذى للمرضى. تلعب بيئة الورم دورًا أساسيًا في تقدم السرطان وتؤثر على كل من الأورام الأولية والمنتشرة. إن استخدام تسلسل الحمض النووي الريبي للخلايا الأحادية لفهم ملفات التباين في بيئة أورام الدماغ مفيد في توجيه قرارات العلاج. للتحقيق بشكل شامل في التباين في الأورام الدبقيّة وانتشار أورام الدماغ المشتقة من مصادر مختلفة (الرئة والثدي)، قمنا بدمج البيانات من ثلاث مجموعات من مجموعات بيانات تسلسل الحمض النووي الريبي للخلايا المفردة المأخوذة من GEO. قمنا بجمع ومعالجة بيانات تسلسل الحمض النووي الريبي للخلايا المفردة من 90,168 خلية تم الحصول عليها من 17 مريضًا. ثم استخدمنا حزمة R Seurat لدمج مجموعات البيانات. بعد ذلك، قمنا بتجميع البيانات ضمن فضاء UMAP وحصلنا على الجينات المعبر عنها بشكل مختلف لتصنيف الخلايا. تؤكد نتائجنا على أهمية البلاعم كعناصر وفيرة ومحورية في الأورام الدبقية. بالمقابل، تظهر انتشارات الرئة إلى الدماغ أعداداً مرتفعة من خلايا AT2، وخلايا CD4+ T السامة، وخلايا CD8+ T المنهكة. على النقيض من ذلك، تتميز انتشارات الثدي إلى الدماغ بوفرة من خلايا الظهارة وmyCAF. لا تُنور دراستنا فقط التباين في TME بين انتشار أورام الدماغ ذات الأصول المختلفة، ولكنها أيضًا تفتح الباب لاستخدام علامات محددة لهذه الأنواع من الخلايا لتمييز الأورام الخبيثة الأولية للدماغ.