بروتوكول لاستخدام نماذج اللغة البروتينية للتنبؤ والتحقق التجريبي من المتغيرات المعززة للوظيفة لإنزيم ثايمين-ن-غليكوزيلز

نماذج اللغة البروتينية (PLMs) هي أدوات تعلم آلي تم تدريبها لتوقع الأحماض الأمينية المخفية ضمن تسلسلات البروتين، مما يوفر فرصًا لتعزيز وظيفة البروتين دون معرفة مسبقة بأدوارها المحددة. هنا، نقدم بروتوكولًا لتحسين ثايمين-دي إن أي-غليكوزيلز (TDG) باستخدام نماذج PLMs. نصف خطوات تحسين الإنزيم "بدون دعم"، وبناء البلازميدات، وإدخال البلازميد المزدوج، والتسلسل عالي الإنتاجية وتحليل البيانات. هذا البروتوكول يحمل وعودًا بتبسيط هندسة أدوات تحرير الجينات، مما يوفر نشاطًا محسنًا مع تقليل عبء العمل التجريبي. للحصول على تفاصيل كاملة حول استخدام وتنفيذ هذا البروتوكول، يرجى الرجوع إلى هي وآخرون.