نماذج درجة الخطر متعددة الجينات للتنبؤ بالبقاء دون مرض الزهايمر باستخدام أسلوب لاسو لنموذج المخاطر النسبية لكوك

الملخص إن التنبؤ ب susceptibility الفرد لمرض معين هو مجال بحث مهم وذو توقيت مناسب. التقنية المعتمدة هي تقدير خطر الفرد بمساعدة نموذج خطر متكامل، وهو درجة خطر متعددة الجينات مع إضافة متغيرات وبائية. ومع ذلك، فإن النماذج المتكاملة لا تأخذ في الاعتبار أي تبعيات زمنية، وقد تقدم تقديرًا نقطيًا للخطر النسبي بالنسبة لسكان مرجعيين. الهدف من هذا العمل مزدوج. أولاً، نستكشف وندعم فكرة التنبؤ بالخطر والبقاء الزمني (المعرف بأنه الوقت الخالي من المرض) للفرد عند بدء المرض. هذا يوفر للممارس رؤية أكثر تفصيلًا للبقاء المطلق كدالة للوقت. ثانياً، لحساب خطر الفرد الزمني، نستخدم المنهجية المنشورة لتناسب نموذج المخاطر النسبية لكوك مع بيانات من دراسة وراثية عن التوقيت لبداية مرض الزهايمر (AD)، باستخدام أسلوب لاسو لإدخال مزيد من المتغيرات الوبائية مثل الجنس، حالة APOE (البروتين الشحمي E، وهو عامل خطر وراثي للAD)، 10 مكونات رئيسية رائدة، ومواقع جينية مختارة. نطبق أسلوب لاسو لنموذج المخاطر النسبية لكوك على مجموعة بيانات من 6792 مريض AD (تتكون من 4102 حالة و2690 ضابطًا) و87 متغيرًا. نظهر أن التوافق مع نموذج لاسو لنموذج المخاطر النسبية لكوك يتيح الحصول على منحنيات بقاء أكثر دقة من الطرق المتطورة (المعتمدة على الاحتمالية). علاوة على ذلك، يسمح المنهج بإنتاج منحنيات بقاء شخصية للمريض، مما يمنح رؤية أكثر تفصيلًا لتقدم المرض المتوقع مما تقدمه النماذج المتكاملة. وقت التشغيل لحساب منحنيات البقاء الشخصية هو أقل من دقيقة لمجموعة البيانات الكاملة لمرضى AD، مما يمكّن من التعامل مع مجموعات بيانات تحتوي على 60,000–100,000 موضوع في أقل من ساعة.