تحليل المتغيرات في المناطق غير المترجمة ومناطق المحفز المرتبطة بخطر الإصابة بسرطان الثدي باستخدام بيانات تسلسل الجينوم الكاملة.

ملخص: استكشفت الدراسات الحديثة المتعلقة بالرابطة الشاملة للأكسوم دور المتغيرات المشفرة في خطر الإصابة بسرطان الثدي، مشددةً على دور المتغيرات النادرة في عدة جينات بما في ذلك BRCA1 وBRCA2 وCHEK2 وATM وPALB2، بالإضافة إلى جينات القابلية الجديدة مثل MAP3K1. ومع ذلك، تفسر هذه الجينات نسبة صغيرة فقط من وراثة المرض المفقودة. من المحتمل أن تكمن معظم الوراثة المفقودة في الجينوم غير المشفر. قمنا بتقييم دور المتغيرات النادرة في المناطق غير المترجمة 5’ و3’ لـ 18,676 جينًا، و35,201 منطقة محفز مفترضة، باستخدام بيانات تسلسل الجينوم الكامل من بنك المملكة المتحدة الحيوية على 8,001 امرأة مصابة بسرطان الثدي و92,534 امرأة غير مصابة بسرطان الثدي. تم إجراء اختبارات حمل واختبارات SKAT-O في مناطق UTR والمحفز. بالنسبة لمناطق UTR لــ 35 جينًا مفترضًا مرتبطًا بخطر سرطان الثدي، قمنا أيضًا بإجراء تحليل تلوي مع مجموعة بيانات كبيرة لحالات سرطان الثدي والشواهد. تم تحديد ارتباطات لـ 8 مناطق عند P<0.0001، بما في ذلك عدة مناطق معروفة بأدوارها في تكون الأورام. كانت أقوى الأدلة على الارتباط للمتحولات في الـ 5’UTR لجين CDK5R1 (P=8.5×10 −7 ). تسلط هذه النتائج الضوء على الدور المحتمل للمناطق التنظيمية غير المشفرة في القابلية للإصابة بسرطان الثدي.