تحليل المعلوماتية الحيوية للإمراض المحتملة وجينات المخاطر للإصابة الدماغية المعززة بالتهاب الأعصاب في النزيف الدماغي داخل الجمجمة

النزيف الدماغي داخل الجمجمة العفوي (غير-traumatic) (ICH) هو أحد الأسباب الرئيسية لوفيات العالم. كان هدف تحليل المعلوماتية الحيوية لدينا هو كشف الأهداف الفسيولوجية المرضية القابلة للحياة ومرشحي الأدوية ذات الجزيئات الصغيرة وتحديد الآليات الثانوية الدقيقة للإصابة الدماغية في ICH. تم تنزيل مجموعة بيانات GSE24265، التي تتكون من بيانات أربعة أنسجة دماغية محيطة بالنزيف وسبع أنسجة دماغية من الجانب المقابل، من قاعدة بيانات جين إكسبريشن أومنيبوس (GEO) وتم فحصها للبحث عن الجينات المعبر عنها بشكل مختلف (DEGs) في ICH. تم استخدام أداة التحليل على الإنترنت GEO2R ووحدة تقييم حساسية الأدوية ضمن أداة المعلوماتية الحيوية ACBI لتحليل تعبير البيانات المختلف. تم استخدام TargetScan وmiRDB وRNA22 للتحقيق في miRNAs المنظمة لـ DEGs. تم إجراء التوصيف الوظيفي لـ DEGs باستخدام موارد علم الجينات (GO)، وتم إجراء تحليل مسارات إشارة الخلية لـ DEGs باستخدام موسوعة كيوتو للجينات والجينومات (KEGG). يُستخدم DAVID لإجراء تحليل enrichment لوظيفة GO وتحليل مسار KEGG لجينات الهدف المرشحة. تم إجراء تحليل enrichment لاستكشاف الآلية الجزيئية لـ DEGs، وتم استخدام شبكات التفاعل بين البروتينات (PPI) وشبكات miRNA - messenger RNA (mRNA) لكشف النقاط المركزية والعلاقات التفاعلية ذات الصلة. تم التعرف على الجينات المركزية وتفاعل miRNA - mRNA لشبكة PPI بواسطة برنامج STRING الإصدار 12.0 وبرنامج Cytoscape. بعد ذلك، تم تحليل DEGs باستخدام قاعدة بيانات L1000CDS2 لتحديد المركبات ذات الجزيئات الصغيرة ذات التأثيرات العلاجية المحتملة. تم تحديد ما مجموعه 325 جينًا مرتفع التعبير و103 جينًا منخفض التعبير المرتبطة بـ ICH. تتعلق الوظائف البيولوجية لـ DEGs المرتبطة بـ ICH بشكل أساسي بالاستجابة الالتهابية، ونشاط الكيموكينات، والاستجابة المناعية. حدد تحليل KEGG عدة مسارات مرتبطة بشكل كبير بـ ICH، بما في ذلك وليس حصراً تفاعل السيتوكين - مستقبل السيتوكين ومسار إشارات MAPK. تم بناء شبكة PPI تتكون من 188 نقطة و563 حافة باستخدام STRING، وتم تحديد 27 جينًا مركزيًا باستخدام برنامج Cytoscape. تحتوي شبكة miRNA - mRNA ذات الاتصال العالي على 27 mRNA رئيسيًا (من C-C motif chemokine ligand 5 (CCL5)، C-C motif chemokine ligand 8 (CCL8)، …، إلى المحفز المرتبط بـ dishevelled 1 (DAAM1)، وFRAT منظم لمسار إشارة WNT 1 (FRAT1)) و135 miRNA مرشح. هذه الجينات وmiRNAs مرتبطة بشكل وثيق بالإصابة الدماغية الثانوية الناتجة عن ICH. بالإضافة إلى ذلك، كشف تحليل L1000CDS2 عن ستة مركبات ذات جزيئات صغيرة كشفت عن إمكانياتها العلاجية. تستكشف دراستنا مسببات إصابة أنسجة الدماغ التي تعززها الالتهابات العصبية في ICH وتوسع من الاستخدام السريري لجيناته الرئيسية. في نفس الوقت، قمنا بإنشاء شبكة miRNA - mRNA التي قد تلعب أدوارًا حاسمة في مسببات ICH. بالإضافة إلى ذلك، حصلنا على ستة مركبات ذات جزيئات صغيرة سيكون لها تأثيرات مضادة للالتهابات على ICH، بما في ذلك Geldanamycin وDasatinib وBMS-345541 وSaracatinib وAfatinib.