Othr-20. التشخيص الجزيئي minimally-invasive الأورام الدبقية الهابطة في جذع الدماغ من خلال تسلسل الحمض النووي الخالي من الخلايا في السائل الدماغي الشوكي

الخلفية إن التشخيص الجزيئي الدقيق للأورام الدبقية الهابطة في جذع الدماغ، بما في ذلك الأورام الدبقية المنتشرة ومتغيرات IDH، أمر ضروري لتوقع النتائج والعلاج الأمثل. إن أخذ خزعة جراحية من جذع الدماغ يحمل خطر العجز العصبي الدائم وقد ينتج عنه نسيج غير كافٍ أو غير تشخيصي. نحن نفترض أن "الخزعة السائلة" الأقل تدخلاً التي تحلل الحمض النووي الخالي من خلايا الورم (cfDNA) في السائل الدماغي الشوكي (CSF) يمكن أن تمثل أسلوبًا بديلًا للتشخيص الجزيئي. طرق قمنا بإجراء اختبار MSK-IMPACT، وهو اختبار سريري موثق من قبل قسم الصحة في ولاية نيويورك يستند إلى تسلسل الحمض النووي من الألواح الملتقطة باستخدام التقنيات الحديثة على 44 عينة من CSF مأخوذة من 37 مريضًا فريدًا يعانون من أورام جذع الدماغ. تراوحت أعمار المرضى عند جمع عينات CSF من 1 إلى 47 عامًا (الوسيط: 29 عامًا). بالنسبة للعينات التي لم يتمكننا من الكشف عن التغيرات التشخيصية فيها، قمنا بإجراء سلسلة من التحليلات الثانوية للتحورات المعروفة مثل H3F3A، IDH1/2، وBRAF، بما في ذلك مراجعة يدوية للقراءات المتحورة التي كانت تحت عتبة الإبلاغ السريري الرسمية، بالإضافة إلى PCR الرقمي السائل (ddPCR). النتائج من بين 44 عينة تم تضمينها في هذه الدراسة، تم اكتشاف طفرات في 10/44 (23%) من العينات بواسطة MSK-IMPACT باستخدام معايير الاتصال السريرية القياسية و14 من العينات المتبقية الـ34 (41%) كانت بها أدلة داعمة لمتحور ذي أهمية تشخيصية استناداً إلى المراجعة اليدوية. تم إجراء اختبار ddPCR على 11 عينة (استناداً إلى توفر الحمض النووي)، كاشفًا عن 4 طفرات إضافية. كانت نسبة التشخيص الإيجابية الإجمالية 64% (28/44). في المرضى الذين تمت خزعتهم، أكد السائل الدماغي الشوكي الطفرات المحددة للمرض في 80% (16/20) من عيّنات CSF، بما في ذلك H3F3A K28M (9/10؛ 90%) وIDH1/2 (5/6؛ 83%). من بين 24 مريضًا لم يتم خزعتهم، تم تحديد طفرة محددة للمرض في 60% (15/25) من عيّنات CSF. الاستنتاجات إن تحليل cfDNA في CSF في المرضى الذين يعانون من أورام جذع الدماغ له نسبة تشخيص عالية ويغني عن الحاجة إلى خزعة نسيجية في غالبية المرضى. يساعد النهج التدريجي لاختبار تسلسل الجيل القادم و ddPCR في تحقيق أقصى استفادة من المعلومات التشخيصية والحساسية.