تنبؤ النقائل الدماغية لسرطان الثدي باستخدام علم الجينوم ذو الجيل التالي.

e14004 الخلفية: كان سرطان الثدي أكثر الأورام الخبيثة شيوعًا التي تم تشخيصها في عام 2023 مع أكثر من 300,000 تشخيص جديد. على الرغم من أنه قابل للعلاج بدرجة كبيرة عند اكتشافه في مراحله المبكرة، إلا أن المرض النقائلي له آثار خطيرة. حوالي 0.4% من جميع الحالات و7.2% من حالات سرطان الثدي النقائلي ستطور نقائل دماغية. ترتبط مستقبلات الهرمونات ارتباطًا ضعيفًا بمخاطر النقائل الدماغية. تظل العوامل التنبؤية لنقائل سرطان الثدي في الدماغ بعيدة المنال. هدف هذا المشروع إلى تحديد العوامل الجينية التي تشكل مخاطر لنقائل سرطان الثدي إلى الدماغ. الطرق: أنشأنا مجموعة استرجاعية من جميع مرضى سرطان الثدي الذين خضعوا لاختبارات تسلسل الجينوم ذو الجيل التالي (NGS) في مركز سرطان شامل وعياداته المرتبطة. تمت جميع اختبارات NGS في المجموعة بواسطة FoundationOne. تم تحديد النقائل الدماغية من خلال رموز ICD-10. تم إجراء تحليل أحادي المتغير باستخدام اختبار فيشر الدقيق. تم تعريف الأهمية كـ p<0.05 بعد تعديل تصحيح الاختبارات المتعددة باستخدام إجراء بنجاميني-هوكبيرغ. تم إنشاء نموذج انحدار لوجستي متعدد المتغيرات؛ لتجنب الإفراط في التكييف، تم تحديد الحد الأقصى لعدد المتغيرات بتطلب 10 حالات لكل متغير مدرج. تم مقارنة تناسب النموذج بواسطة إحصاء معيار المعلومات لأكاكي (AIC). تم استخدام SAS الإصدار 9.4 لجميع التحليلات. النتائج: شملت هذه المجموعة النهائية 242 مريضًا، منهم 29 (12%) طوروا نقائل دماغية. من بين اللوحة القياسية التي تضم 223 جينًا تم اختبارها، كان 11 مرتبطًا بشكل كبير بالنقائل الدماغية بعد تصحيح الاختبارات المتعددة. تضمنت الجينات المهمة: TP53، GATA3، PIK3CA، EP300، MSH3، NTRK1، BRCA1، CBFB، FGFR4، MAP2K2، وNOTCH2. كانت TP53 الطفرات الجينية الأكثر انتشارًا بين مرضى النقائل الدماغية. كان الجين موجودًا في 79% (23/29) من جميع حالات النقائل الدماغية و96% (23/24) من المرضى الذين يحملون TP53 كان لديهم نقائل دماغية. كانت PIK3CA وGATA3 الأكثر شيوعًا في 10 (34%) و6 (21%) حالات على التوالي. عند بناء نماذج تنبؤية، كانت النموذج المثالي يشمل TP53 وGATA3 وCBFB الذي قدم AIC من 33.15 وAUC من 0.98. كان أفضل نموذج يتضمن متغيرين هو TP53 وPIK3CA مع AIC من 49.67 وAUC من 0.95. الاستنتاجات: من بين هذه المجموعة، وُجد أن 11 جينًا مرتبط بشكل كبير بتطور النقائل الدماغية. من بينهم، كانت TP53 الأكثر انتشارًا بينما ساهمت GATA3 وPIK3CA وCBFB أيضًا في القدرة التنبؤية. تقترح هذه المتغيرات مستويات عالية من القابلية للتنبؤ، على الرغم من أنه نظرًا للعينة المحدودة، سيكون من الضروري إجراء تحقق شامل. ومع ذلك، نظرًا للعدد الكبير من الجينات المرتبطة وبدء القابلية التنبؤية المهمة، هناك إمكانيات لتحديد NGS أولئك الذين في خطر أعلى للنقائل الدماغية. سيكون من الضروري إجراء مزيد من الدراسات وتوسيع NGS للتحقق من هذه النتائج والتحقيق في توقيت النقائل الدماغية لفرصة الاكتشاف المبكر.