تحليل تسلسل ترانسكريبتوم المتكامل وتحليل شبكة التعبير الجيني المشترك الموزون يكشف عن الجينات الرئيسية في سرطانات الغدة الدرقية الجلديّة

الهدف: يمثل سرطان الغدة الدرقية الجلديّة (PTC) غالبية حالات سرطان الغدة الدرقية وله معدل عودة مرتفع. كان هدفنا هو فحص الجينات الرئيسية المشاركة في PTC لتقديم رؤى جديدة حول آليات المرض. الطرق: تم تنزيل سبعة مجموعات بيانات ميكروية لسرطان الغدة الدرقية الجلديّة من قاعدة بيانات التعبير الجيني. تم فحص الجينات المعبر عنها بشكل مختلف (DEGs) بين PTC والعينات الطبيعية في مجموعة البيانات المدمجة. ثم تم استخدام تحليل الوحدات الوظيفية لتفاعلات البروتينات (PPIs) وتحليل شبكة التعبير الجيني المشترك الموزون (WGCNA) لتحديد الجينات الرئيسية المرتبطة بـ PTC. تم بعد ذلك تصنيف الجينات الرئيسية التي تم تحديدها من جوانب مختلفة، بما في ذلك تحليل إثراء مجموعة الجينات (GSEA) والارتباطات مع تسلل المناعة، ومستويات الميثيل، والتنبؤ. النتائج: تم تحديد عدد كبير من DEGs، وهذه الجينات تشارك في عدة مسارات سرطانية. تم تحديد تسعة جينات رئيسية (بما في ذلك الجينات المثبطة GNA14، AVPR1A، وWFS1، والجينات المنشطة LAMB3، PLAU، MET، MFGE8، PRSS23، وSERPINA1). كان لدى المرضى في مجموعات التعبير المرتفع لـ AVPR1A وGNA14 بقاء خالي من المرض (DFS) أفضل من الذين في مجموعة التعبير المنخفض. كانت الجينات الرئيسية تشارك بشكل أساسي في مسار P53، استجابة الإستروجين، الموت الخلوي المبرمج، التحلل السكري، إشارات NOTCH، انتقال الظهارة المتوسطة، إشارات WNTbeta كاتينين، والاستجابة الالتهابية. كان تعبير الجينات الرئيسية مرتبطاً بتسلل الخلايا المناعية ومستويات الميثيل المقابلة. كانت نتائج التحقق من مستويات بروتينات الجينات الرئيسية وmRNA باستخدام مجموعات بيانات تحقق خارجية متوافقة مع توقعاتنا، مما يعني مشاركة الجينات الرئيسية في PTC. الاستنتاج: قد تعمل الجينات الرئيسية كأهداف علاجية محتملة لـ PTC. تقدم هذه الدراسة رؤى جديدة حول الآليات وراء تطور PTC.