أدلة جينية على التحبب القديم والتأثير المشترك للمناخ القديم في تنويع الأسماك الكهفية

ملخص تظهر الأسماك الكهفية تعديلات تروغلو مرفولوجية واضحة، مثل تدهور البصر، وفقدان الصبغة، وتقليل الحراشف، كاستجابات متخصصة للبيئات تحت الأرض. من بين هذه، تمثل لوتشات الكهوف (CLS) من عائلة نيمشيلايد المجموعة الثانية الأكثر تنوعًا من الأسماك الكهفية في الصين؛ ومع ذلك، لا تزال تاريخها التطوري غير مفهومة جيدًا. لسد هذه الفجوة المعرفية، قمنا بإعادة تسلسل الجينوم الكامل لـ 62 نوعًا من CLS واثنين من الأنواع القريبة، مكملين هذه البيانات مع الموارد الجينية المنشورة. كشفت السلسلة التطورية المعاد بناؤها أن التحبب القديم هو القوة الدافعة الرئيسية وراء التباين التطوري، مع تصنيف غير مكتمل للنسل كعامل ثانوي. تسببت التقلبات المناخية في عصر البلايستوسين، جنبًا إلى جنب مع الهياكل الجينية الخاصة بالأنواع، في توليد أربع مسارات ديموغرافية متميزة عبر السكان. بالإضافة إلى ذلك، رسمنا أربعة مراحل متميزة من تنوع النسل في CLS، شكلتها التفاعلات التكتونية والمناخية، مع فترات متناوبة من التسارع والانخفاض تتزامن مع دورات الجبال الآسيوية والموسمية. توفر هذه الدراسة أول وجهة نظر جينية متكاملة عن تطور CLS، موضحة كيف شكلت العوامل البيئية وغير البيئية معًا التنوع البيولوجي تحت الأرض.