تحتوي التربة على أعلى تركيز من الميكروبات في النظم البيئية، وتعتبر توصيفاتها الجزيئية من خلال التسلسل عالي الإنتاجية ضرورية لدراسات الميتاجينوم. ومع ذلك، فإن الحصول على حمض نووي عالي الجودة ومرتفع التركيز مقيد بالخصائص الفيزيائية والكيميائية (درجة الحموضة، المعادن الثقيلة، الأحماض الدبالية) وامتصاصه إلى معادن الطين. على الرغم من وجود بروتوكولات تجارية قياسية، إلا أنها تقدم قيودًا متغيرة حسب نوع التربة. قام هذه الدراسة بتطوير وتحقيق الطريقة المستخدمة من قبل المركز الوطني للموارد الجينية - مجموعة الميكروبات (CNRG-CM)، والتي تتضمن خطوات غسيل مبتكرة باستخدام محلول ملحي مخفف بالفوسفات (PBS) وفوسفات الصوديوم لإزالة الأحماض الدبالية المثبطة والأيونات المعدنية بشكل فعال، بالتزامن مع استخراج بروميد السيتيل ثلاثي الميثيل الأمونيوم (CTAB)/الكحول المكلور لتحقيق عزل الحمض النووي الميتاجينومي ذو الوزن الجزيئي العالي. تم تطبيق طريقة CNRG-CM على ثلاثة أنواع متنوعة من التربة مع خصائص فيزيائية وكيميائية متغيرة، واستعادة تركيزات الحمض النووي التي تتراوح من 1000 إلى 1300 نانوغرام/ميكرولتر مع عائد يتراوح من 30 إلى 48 ميكروغرام/جرام−1، متجاوزة بشكل ملحوظ تلك التي تم الحصول عليها باستخدام مجموعة تجارية قياسية بحد أقصى لتركيز الحمض النووي 360 نانوغرام/ميكرولتر وعائد 43 ميكروغرام/جرام−1. تم تأسيس بروتوكول CNRG-CM كبديل فعال وقابل للتكيف لاستخراج الحمض النووي الميتاجينومي عبر سياقات زراعية وإيكولوجية متنوعة. كما يسمح بإجراء دراسات ميتاجينومية لاحقة لمجتمعات الميكروبات في التربة.
درس هيرنانديز-كروز وآخرون (مون) هذا السؤال.