تحفز تفاعلات الإنزيمات الكيميائية التحولات الكيميائية الأساسية للأنظمة البيولوجية وتطبيقات صناعية متنوعة. ومع ذلك، يبقى فك الروابط المعقدة بين الإنزيمات وتفاعلاتها التحفيزية تحديًا. هنا نقدم EnzymeCAGE، وهو نموذج أساسي هندسي محدد تحفيز تم تدريبه على حوالي 1.5 مليون زوج من الإنزيمات-التفاعلات المستندة إلى الهيكل، والتي تشمل أكثر من 3,000 نوع. يدمج EnzymeCAGE بنية متعددة الوسائط واعية للهندسة مع المعلومات التطورية لنمذجة الاعتمادات بين هيكل الإنزيم، وظيفة التحفيز وتخصص التفاعل. نُظهر أن EnzymeCAGE يتكيف مع كلا من الهياكل التجريبية والمتوقعة للإنزيمات، ويكون قابلاً للتطبيق عبر مجموعة واسعة من عائلات الإنزيمات والمواد الأيضية. تكشف التقييمات الشاملة عن أداء متقدم في التنبؤ بوظائف الإنزيمات، وإزالة اليتامى من التفاعلات، وتحديد المواقع التحفيزية وإعادة بناء المسارات البيوسنثيزية، مما يسلط الضوء على إمكانية هذا النهج لتسريع اكتشاف وهندسة المحفزات الحيوية المتقدمة.
درس Liu وآخرون (الخميس) هذا السؤال.