يظل تحديد السياق البيولوجي للمواد الأيضية الميكروبية تحديًا كبيرًا. نقدم microbiomeMASST، وهو رسم بياني مدفوع بالبيانات الوصفية يقوم بتخريج المواد الأيضية عبر 467 مجموعة بيانات متاحة تحتوي على 144,424 ملف مطيافية الكتلة من البشر والحيوانات وأنظمة زراعة الميكروبات. يدمج microbiomeMASST الثقافات الأحادية، والمجتمعات الاصطناعية، وعينات مرتبطة بالمضيف عبر مواقع جسم متعددة ونباتات. يمكن استعلام طيف MS/MS لتتبع حدوثه عبر المضيفين، والظروف التجريبية، والتدخلات، مما يمكِّن من تكامل البيانات عبر الدراسات. نعرض هذا الإطار من خلال وضع المواد الأيضية الميكروبية المقرونة بالأحماض الصفراوية في سياق، واستجواب أدوية التمثيل الغذائي المدعومة من الميكروبيوم. أظهر فحص بكتيريا الأمعاء نزع البرولين من دواء إنالابريل، وهو مثبط لإنزيم تحويل الأنجيوتنسين (ACE). باستخدام microbiomeMASST، تتبعنا هذه المادة الأيضية عبر مجموعات بشرية، وعينات ميكروبية، وعينات بيئية، وفي غوريللا غوريلا. أظهرت نماذج الهيكل والتحليل الإنزيمي أن نزع البرولين الميكروبي يلغي تثبيط ACE، مما يعطل تأثيره العلاجي. معًا، يربط microbiomeMASST طيف MS/MS بالسياق البيولوجي، محولاً الملاحظات المعزولة إلى خريطة ميكروبيوم قابلة للتفسير لتحليل عبر الدراسات.
درس شاربون-لامورو وآخرون (الخميس) هذا السؤال.