لقد مكنت التطورات الحديثة في تقنيات تسلسل مثيلة الحمض النووي للخلايا المفردة (scDNAm) من وصف المناظر الجينية بدقة غير مسبوقة، مما يوفر رؤى حول التباين الخلوي، والتمايز، والتطور. يسمح استنتاج المسار، الذي يرتب الخلايا على طول الزمن الزائف، للباحثين بتتبع التغيرات الجينومية عبر حالات الخلايا المستمرة وتحديد المواقع الجينية الرئيسية التي تظهر مثيلة مختلفة. ومع ذلك، لا توجد حاليًا طرق لنمذجة التغيرات في المثيلة عند طول الزمن الزائف في بيانات scDNAm. هنا نقدم إطار بايزي هرمي للتحليل بيانات scDNAm. طريقتنا، المسماة mist (استنتاج المثيلة لخلايا منفردة على طول المسار)، نمذج التغيرات البيولوجية الخاصة بالمرحلة، وتحدد الميزات الجينومية ذات التغيرات الكبيرة في المثيلة على طول الزمن الزائف، وتنفذ تحليل المثيلة المختلفة عبر المجموعات الظاهرية. تظهر المحاكاة دقتها الفائقة في الكشف عن جينات DM على طول الزمن الزائف مقارنة بالطرق الموجودة. عند تطبيقها على مجموعات البيانات متعددة الأوميات لتطور الجنين الفأري والدماغ البشري النامي، تحدد mist المنظمين التطوريين الرئيسيين، الذين تتوافق أنماط مثيلتهم مع انتقالات السلالة. mist متاحة للجمهور كحزمة R/Bioconductor. تتبع مثيلة الحمض النووي للخلايا المفردة انتقالات حالات الخلايا التطورية، لكن الطرق الموجودة تكافح لنمذجة التغيرات التدريجية على مر الزمن الزائف. هنا، يقدم المؤلفون نهجًا بايزيًا يقدر التباين الخاص بالمرحلة ويجد المثيلة الديناميكية.
درس Duan et al. (Thu) هذا السؤال.