الشفاء الجزئي من الميكروبيوم بعد العلاج بالمضادات الحيوية

تؤثر المضادات الحيوية بشكل كبير على ميكروبيوم الأمعاء وتعدل المجتمعات الميكروبية. لقد لاحظنا مؤخرًا أن الأدوية المضادة للميكروبات تؤثر أيضًا على وفرة وتوزيع جينات مقاومة المضادات الحيوية. في هذا الملحق، نعيد تحليل مجموعة بيانات الميتاجينوم الخاصة بنا والتي تحتوي على حوالي تريليون نوكليوتيد لقياس الاختلافات الجينومية الشاملة على مستوى التسلسل قبل وبعد العلاج بالمضادات الحيوية. نظهَر أن التعرض لمدة 7 أيام لمادة سيفبروزيل يؤدي إلى فقدان ذو دلالة إحصائية في تسلسلات الميتاجينوم. كان الشفاء من ميكروبيوم الأمعاء بعد 3 أشهر من العلاج بالمضادات الحيوية مميزًا بظهور تسلسلات جينية جديدة لم تُلاحظ قبل التعرض للمضادات الحيوية. كان لدى المشاركين الذين يتمتعون بتنوع منخفض في ميكروبيوم الأمعاء كمية متزايدة من التسلسلات المتعلقة بمقاومة المضادات الحيوية. لذلك، نقترح أنه بينما تتأثر التركيبة التصنيفية للميكروبيوم جزئيًا بالمضاد الحيوي، فإن المحتوى الجينومي وهيكل السكان للمجتمعات البكتيرية يتأثر بشكل ملحوظ.