Key points are not available for this paper at this time.
يلعب الانضمام غير المتجانس للنهايات (NHEJ) دورًا مهمًا في إصلاح الكسر المزدوج السلسلة (DSB) للحمض النووي. أظهرت الدراسات الحديثة أن أنماط الأخطاء في NHEJ متحيزة بشدة من قبل سياق التسلسل، لكن هذه الدراسات كانت تعتمد على عدد قليل نسبيًا من النماذج. للتحقيق في هذا بشكل أكثر شمولًا، قمنا بتحليل منهجي لحوالي 1.16 مليون حدث طفرات مستقل ناتج عن الشق المتوسّط CRISPR/Cas9 وإصلاح DSB المدعوم بـ NHEJ لـ 6872 تسلسل مستهدف صناعي، تم إدخاله إلى خط خلوى بشري عبر عدوى فيروسية لنتيجة. نجد أن: (i) تهيمن الأحداث التي تتعلق بالإدخالات من bp 1 الموجهة بواسطة التسلسل الذي يقع مباشرة فوق موقع الشق، (ii) ترتبط الحذوفات بشكل رئيسي بالميكروهومولوجي و (iii) تعرض الأهداف تنوعًا متفاوتًا لكنه قابل للتكرار من حيث عدد وتكرار النتائج الطفرية التي تؤدي إليها. من هذه البيانات، قمنا بتدريب نموذج يستخدم سياق التسلسل المحلي لتوقع توزيع النتائج الطفرية. من خلال استغلال تحيز نتائج NHEJ نحو الأحداث المعتمدة على الميكروهومولوجي، نوضح برمجة أنماط الحذوفات عن طريق إدخال ميكروهومولوجي إلى مواقع محددة بالقرب من موقع DSB. نتوقع أن نتائجنا ستساعد في التحقيقات المتعلقة بآليات إصلاح DSB وكذلك تصميم تجارب CRISPR/Cas9 لتطبيقات متنوعة تشمل فحص الجينوم، والعلاج الجيني، وتتبع السلالات والتسجيل الجزيئي.
درس تشين وآخرون (الجمعة) هذا السؤال.