العلاقة بين التشكيلات الأصلية والهياكل التجريبية للبروتينات

تحتوي الهياكل التجريبية المختلفة لنفس البروتين أو للبروتينات ذات التشابه العالي في التسلسل على العديد من الاختلافات الصغيرة. هنا، نقوم ببناء تشكيلات من الهياكل "بنك بيانات البروتينات ذات التشابه العالي في التسلسل" (HSP) وننظر في مدى تمثيل هذه التشكيلات للتنوع الهيكلي للحالة الأصلية في المحلول. نجد أن قياسات الرنين المغناطيسي النووي المختلفة التي تستكشف الهيكل والديناميات لبروتينات معينة في المحلول، بما في ذلك معلمات النظام، والرباطات السلمية، والرباطات القطبية المتبقية، يتم إعادة إنتاجها بشكل جيد من خلال تشكيلات بنك بيانات البروتينات ذات التشابه العالي في التسلسل؛ وعلاوة على ذلك، نوضح أن تأثيرات عدم اليقين في تحديد الهيكل غير كافية لتفسير النتائج. تبرز هذه النتائج أهمية الأخذ في الاعتبار الديناميات البروتينية في الحالة الأصلية عند إجراء مقارنات مع البيانات التجريبية المتوسطة الناتجة عن التشكيلات، وتقترح أنه حتى عدد معتدل من الهياكل لبروتين محدد تم تحديده تحت ظروف مختلفة، أو مع اختلافات صغيرة في التسلسل، يمكن أن يلتقط مجموعة تمثيلية من التشكيل الأصلي الحقيقي.