تجميع عالي الجودة للجينوم والتغيرات الميثيلية للجنس التفاحي في مراحل تطور الثمار المبكرة

باستخدام أحدث تقنيات التسلسل ورسم الخرائط البصرية، قمنا بإنتاج تجميع عالي الجودة للجينوم التفاحي (Malus domestica Borkh.). كانت التسلسلات المتكررة، التي تمثل أكثر من نصف التجميع، توفر فرصة غير مسبوقة للتحقيق في المناطق غير المعروفة من جينوم الشجرة؛ لقد حددنا تسلسل جديد من المتحولات الرجعية فائقة التكرار الذي كان مفرط التواجد في المناطق الهيتر كروماتينية، وقدرنا أن اندلاعاً كبيراً لعناصر قابلة للنقل مختلفة (TEs) حدث منذ 21 مليون سنة. من الجدير بالذكر أن توقيت هذا الانفجار من عناصر النقل توافق مع ارتفاع جبال تيان شان، التي يُعتقد أنها مركز المنشأ للجنس التفاحي، مما يشير إلى أن عناصر النقل والعمليات المرتبطة قد تكون ساهمت في تنوع سلف التفاح وربما في تباعده عن الكمثرى. أخيراً، تشير بيانات الميثيل الحمضي على مستوى الجينوم إلى أن العلامات المؤثرات قد تساهم في جوانب ذات صلة زراعية، مثل تطور ثمار التفاح.