التمثيل الحيوي للأحماض الأمينية العطرية

يناقش هذا الفصل بالتفصيل الجينات والبروتينات في الإشريكية القولونية التي تشارك في التمثيل الحيوي ونقل الأحماض الأمينية العطرية الثلاثة: التيروزين، والفينيل ألانين، والتريبتوفان. يوفر الفصل منظورًا تاريخيًا حول توضيح التفاعلات المختلفة للطريق المشترك الذي يحول إريثروز-4-فوسفات وفوسفوينولبيوروفات إلى الكوريسمات، وتفاعلات الطرق النهائية الثلاثة التي تحول الكوريسمات إلى الفينيل ألانين، والتيروزين، والتريبتوفان. كما يتم مناقشة تنظيم التفاعلات الرئيسية من خلال تثبيط التغذية الراجعة، والتخفيف، والقمع، والتفعيل. يلعب بروتينان تنظيميّان، TrpR (108 أحماض أمينية) وTyrR (513 أحماض أمينية)، دورًا رئيسيًا في التنظيم النسخي. يعمل بروتين TrpR فقط كديمر والذي، في وجود التريبتوفان، يقمع تعبير مشغل trp بالإضافة إلى أربعة جينات أخرى (نظام تحكم TrpR). بروتين TyrR، الذي يمكن أن يعمل كديمر وكهكسير، ينظم تعبير تسعة جينات تشكل نظام التحكم TyrR. يمكن أن يرتبط TyrR بكل من الأحماض الأمينية العطرية الثلاثة و ATP وتحت تأثيرها يمكن أن يعمل كقامع أو منشط لتعبر الجينات. يتم وصف المجالات المختلفة لهذا البروتين المعنية بارتباط الأحماض الأمينية العطرية و ATP، والتعرف على مواقع الربط في الحمض النووي، والتفاعل مع الوحدة الفرعية ألفا من RNA البوليميراز، والانتقال من مونومر إلى ديمر أو كهيكسير. كما يتم تحليل الاستراتيجيات المختلفة التي تسمح لـ TyrR بالتعاون مع أحماض أمينية معينة بتأثير مختلف على تعبير الجينات الفردية لنظام التحكم TyrR.