أمواج انتشار الريبوتارنسوسون تعيد تشكيل تنظيم الجينوم وارتباط CTCF في عدة سلالات ثدية

تمثل مواقع ارتباط CTCF تسلسلات تنظيمية مقيدة بشدة على مدى تطور الكائنات الحية. لاكتساب فهم حول كيفية حفاظ هذه العناصر الجينية وانتشارها عبر الجينوم، عرّفنا الطيف الكامل لمواقع ارتباط CTCF، بما في ذلك نمط بحجم 33/34، وحددنا أكثر من خمسة آلاف موقع لارتباط CTCF محفوظ، قوي ومستقل عن النسيج من خلال مقارنة بيانات ChIP-seq لستة ثدييات. تشير بياناتنا إلى أن تفعيل العناصر الراجعة قد أنتج توسعات محددة بالأنواع لارتباط CTCF في القوارض والكلاب والجرذان، والتي تعمل في كثير من الأحيان كعوازل كروماتينية ونسخية. اكتشفنا عناصر متكررة متحجرة تحيط بمناطق ارتباط CTCF المحفوظة بعمق، مما يشير إلى أن توسعات مماثلة للريبوتارنسوسون حدثت منذ مئات الملايين من السنين. يعد انتشار ارتباط CTCF المدفوع بالتكرار آلية أساسية وعتيقة وما زالت نشطة للغاية في تطور الجينوم في السلالات الثديية.