تحليل شامل لانحلال الرنا المرسال في الخلايا الليمفاوية التائية البشرية الأولية المستريحة والمنشطة

استخدمنا تقنية الميكروأري لقياس معدلات انحلال الرنا المرسال في الخلايا الليمفاوية التائية المستريحة والمنشطة من أجل فهم أفضل لدور انحلال الرنا المرسال في تنظيم التعبير الجيني. تم تحفيز الخلايا الليمفاوية التائية البشرية المنقاة لمدة 3 ساعات باستخدام الوسط فقط، أو باستخدام جسم مضاد مضاد لـ CD3، أو باستخدام مزيج من جسم مضاد مضاد لـ CD3 وجسم مضاد مضاد لـ CD28. تم إضافة أكتينوميسين د لإيقاف النسخ، وتم جمع إجمالي الRNA الخلوية في نقاط زمنية منفصلة على مدى 2 ساعة. تم تحليل الRNA من كل نقطة باستخدام مصفوفات أوليغونوكليوتيد من أفيمتريكس وتم استخدام نموذج انحلال من الرتبة الأولى لتحديد نصف أعمار ما يقرب من 6000 عبارة معبرة. لقد حددنا مئات من العبارات ذات الحياة القصيرة التي ترمز إلى بروتينات تنظيمية مهمة بما في ذلك السيتوكينات، مستقبلات سطح الخلايا، منظمات نقل الإشارة، عوامل النسخ، منظمات دورة الخلية ومنظمات موت الخلايا المبرمج. احتوت حوالي 100 من هذه العبارات ذات الحياة القصيرة على تسلسلات شبيهة بـ ARE. كما حددنا العديد من العبارات التي أظهرت تغييرات تعتمد على المثير في انحلال الرنا المرسال. بشكل خاص، حددنا مئات من العبارات التي كانت مستوياتها الثابتة مكبوحة بعد تنشيط الخلايا التائية و كانت إما غير مستقرة في الحالة المستريحة أو غير مستقرة بعد تفعيل الخلايا. وبالتالي، يبدو أن انحلال الرنا المرسال بسرعة هو آلية مهمة لإيقاف التعبير الجيني بطريقة تعتمد على التنشيط.