كم يكفي؟ آثار النسخ الفنية والبيولوجية على تحليل النظام الغذائي باستخدام تسلسل الحمض النووي

يتم استخدام تسلسل الحمض النووي بشكل متزايد في الدراسات الغذائية لتقدير التنوع والتكوين وتكرار ظهور العناصر الغذائية. ومع ذلك، فإن القليل من الدراسات قد قيمت كيف تؤثر النسخ الفنية والبيولوجية على دقة تقديرات النظام الغذائي. تتناول هذه الدراسة هذه القضايا باستخدام خفاش الأجنحة الحرة الأوروبي Tadarida teniotis، مع إجراء تسلسل عالي الإنتاجية لجزء صغير من جين COI في 15 كومة براز منفصلة و15 كومة للفرد لكل من 20 خفاشًا. تحققنا من كيفية تأثر أوصاف النظام الغذائي بالمتغيرات بين (أ) الأفراد، (ب) الكومات لكل فرد و (ج) عمليات تفاعل البلمرة المتسلسل لكل كومة. بالإضافة إلى ذلك، تحققنا من تأثير (د) تحليل كومات منفصلة مقابل كومات مدمجة. وجدنا أن تقديرات تنوع النظام الغذائي زادت بشكل ثابت مع عدد الكومات المحللة لكل فرد، حيث كانت هناك حاجة إلى سبع كومات لاكتشاف حوالي 80٪ من أنواع الفرائس. كانت معظم الاختلافات في تكوين النظام الغذائي مرتبطة بالاختلافات بين الخفافيش الفردية، تليها الكومات لكل فرد وعمليات تفاعل البلمرة المتسلسل لكل كومة. زادت دقة تقديرات تكرار الظهور مع زيادة عدد الكومات المحللة لكل خفاش، وكانت أعلى معدلات الخطأ مسجلة للفرائس التي يتم استهلاكها بشكل غير متكرر من قبل العديد من الأفراد. قدمت الكومات تقديرات ضعيفة لتنوع النظام الغذائي وتكرار الظهور، والتي كانت مشابهة لتحليل كومة واحدة لكل فرد، وغالبًا ما فاتت العناصر الغذائية الأقل شيوعًا. بشكل عام، تؤكد نتائجنا أن زيادة النسخ البيولوجية أمر بالغ الأهمية في دراسات تسلسل الحمض النووي الغذائي وتؤكد أن تحليل عدة عينات لكل فرد بدلاً من العينات المجمعة ينتج نتائج أكثر دقة.