Key points are not available for this paper at this time.
تم تطبيق دالة تقييم قائمة على ميكانيكا الكم (QM) على مركبات كيناز المعتمد على السايكلين 2 (CDK2) وثلاثين مثبطًا قائمًا على البيرازولو1,5-أبريمدين ومرادفاته الحيوية. تم استخدام إعداد هجين ثلاثي الطبقات من QM/MM (DFT-D/PM6-D3H4X/AMBER في مذيب بورن المعمم) هنا لأول مرة كامتداد لأساليب QM الكاملة وSQM/MM السابقة (SQM تعني QM شبه التجريبية). تم فحص طريقتين للحصول على هياكل مركبات CDK2/المثبطات: 1) بناء التعديلات من هيكل الأشعة السينية المتاح بالاقتران مع بحث زوايا التشكيل و2) ربط المركبات بـ CDK2. تضمنت دالة التقييم القائمة على QM تحسين QM/SQM/MM تلاها حسابات درجات الارتباط والتي ارتبطت لاحقًا بحسابات الطاقة الحرة المرتبطة بالتجارب. كانت العلاقة لطريقة البناء جيدة (r(2) = 0.64، مؤشر التنبؤ = 0.81)، بينما فشلت طريقة الارتباط. سمحت لنا تفكيك طاقات التفاعل إلى قطع من الليجان بتبرير الاختلافات في قوى الارتباط. في الختام، قمنا بتطوير وتحسين بروتوكول تقييم قائم على QM وطبقناه بنجاح لاستنساخ قوى الارتباط في سلسلة متجانسة من مثبطات CDK2 وتبرير قوتها. وبالتالي، نقترح أن مثل هذه الأداة يمكن استخدامها في تصميم الأدوية العقلاني المعتمد على الكمبيوتر.
درس براهمكشاتريا وآخرون (سون) هذا السؤال.