Key points are not available for this paper at this time.
المتاسيل هي تجمعات خلوية مشتقة من بيانات تسلسل الخلايا الفردية تمثل حالات خلوية متميزة وعالية الدقة. هنا نقدم تجميع الخلايا الفردية لحالات الخلايا (SEACells)، وهو خوارزمية لتحديد المتايسل التي تتجاوز ندرة بيانات الخلايا الفردية بينما تحتفظ بالتنوع الذي يحجبه التجميع التقليدي للخلايا. SEACells يتفوق على الخوارزميات الموجودة في تحديد المتايسل الشاملة، المدمجة، والمفصولة جيدًا في كل من RNA واختبار الوصول إلى الكروماتين (ATAC) عبر بيانات تحتوي على أنواع خلايا منفصلة ومسارات مستمرة. نوضح استخدام SEACells لتحسين ارتباطات الجينات، حساب درجات جينات ATAC واستنتاج أنشطة المنظمين الرئيسيين أثناء التمايز. تحليل مستوى المتايسل يتناسب مع مجموعات بيانات كبيرة وهو مناسب بشكل خاص لمجموعات المرضى، حيث يوفر التجميع لكل مريض وحدات أكثر موثوقية لدمج البيانات. نستخدم متايسلنا لكشف ديناميات التعبير وإعادة تكوين منظر الكروماتين تدريجيًا خلال التمايز الدهني، ولتحديد حالات تمايز وتنشيط خلايا CD4 T المرتبطة ببدء وشدة المرض في مجموعة مرضى فيروس كورونا 2019 (COVID-19).
بيرساد وآخرون (الإثنين) درسوا هذا السؤال.