التوصيف الجيني لفيروس نخر الدم المقعدي المعدي من مخزونات السلمون البحرية في ولاية واشنطن

فيروس نخر الدم المقعدي المعدي (IHNV) هو مسبّب عدوى يصيب العديد من مخزونات السلمون في المحيط الهادئ من أحواض أنهار أمريكا الشمالية. الدراسات السابقة أظهرت تنوعًا جينيًا شاملًا لعزل فيروس IHNV من ألاسكا ووادي هاجيرمان في إيداهو. لتعزيز فهم التطور وأنماط انتقال الفيروس IHNV ضمن النطاق الجغرافي للشمال الغربي الهادئ، قمنا بتحليل جين G لعزل فيروس IHNV من الأحواض الساحلية في ولاية واشنطن باستخدام اختبار حماية الريبونوكلياز (RPA) وتسلسل النوكليوتيدات. أظهرت تحليل RPA لـ 23 عزلًا أن عزلات IHNV في حوض سكيغيت كانت متجانسة نسبيًا نتيجة هيمنة نوع واحد من جين G (S). أكدت تحليل التسلسل لـ 303 قواعد في منتصف جين G (منطقة midG) لـ 61 عزلًا التردد العالي لتسلسل حوض نهر سكيغيت وحددت تسلسلًا آخر شائعًا موجودًا في العزلات من حوض بحيرة واشنطن. بشكل عام، أظهر كل من تحليل RPA وتحليل التسلسل أن عزلات IHNV الساحلية في واشنطن متجانسة جينيًا ولها تنوع جيني قليل. هذا مشابه لنمط التنوع الجيني لفيروس IHNV من ألاسكا ويتعارض بشكل حاد مع التنوع الجيني العالي الذي تم إثباته لعزلات IHNV من مزارع الأسماك على طول نهر سنيك في إيداهو. تشير الدرجة العالية من تشابه التسلسل والأنماط بين عزلات IHNV الساحلية في واشنطن وتلك الموجودة في ألاسكا وكولومبيا البريطانية إلى أنها تمتلك سلفًا فيروسياً مشتركًا. تؤكد تحليلات النساب للعزلات التي درسناها وتلك الموجودة في مناطق مختلفة عبر النطاق الجغرافي للفيروس نمطًا محفوظًا من تطور الفيروس في مخزونات السلمون شمال نهر كولومبيا، الذي يشكل الحدود الجنوبية لولاية واشنطن.