هيكل شبكات تنظيم الجينات التي تتحكم في تطور الزهور في أرابيدوبسيس ثاليانا

تعمل عوامل النسخ المنزلية الزهرية (TFs) بطريقة تركيبية لتحديد هويات الأعضاء في الزهرة. ومع ذلك، لا يزال هيكل ووظيفة شبكة تنظيم الجينات (GRN) المتحكمة في تحديد الأعضاء الزهرية غير مفهومة بشكل جيد. على وجه الخصوص، لم يتم دراسة الروابط بين عوامل النسخ المنزلية، والميكروRNAs (miRNAs) وغيرها من العوامل التي تتحكم في بدء ونمو الأعضاء بصورة منهجية حتى الآن. هنا، باستخدام مجموعة من بيانات ارتباط عوامل النسخ على مستوى الجينوم، وبيانات التعبير عن المرسال RNA والميكروRNA، نعيد بناء شبكة GRN الديناميكية التي تتحكم في تطوير الميرستيم الزهري وتمايز الأعضاء. نحن نحدد الحلقات التغذوية الأمامية السائدة (FFLs) التي تتوسطها عوامل النسخ المنزلية الزهرية وmiRNAs التي تنظم أهدافًا شائعة. تُظهر التحقق التجريبي من FFL متناسق أن حجم البتلة يتحكم فيه وحدة miR319/TCP4 التي تنظمها SEPALLATA3. نوضح أيضًا أن ارتباط عوامل النسخ المنزلية المختارة وعوامل النسخ الأخرى هو مؤشر على أنماط التعبير الجيني الخاصة بالأعضاء. تقدم نتائجنا موردًا قيمًا لدراسة العمليات التنظيمية الجزيئية التي تكمن وراء تحديد الأعضاء الزهرية في النباتات.