الكشف عن تعقيد ترانسكريبتوم الذرة بواسطة تسلسل القراءة الطويلة لجزيء واحد

Zea mays هو نموذج جيني مهم لتوضيح الشبكات الترنسكريبتية. إن عدم اليقين بشأن الهيكل الكامل لترانسكرipts mRNA يحد من تقدم الأبحاث في هذا النظام. هنا، باستخدام تقنية تسلسل جزيء واحد، أنتجنا 111, 151 ترانسكرipts من 6 أنسجة تلتقط حوالي 70% من الجينات المثبتة في جينوم الذرة RefGenᵥ3. يمثل جزء كبير من الترنسكريبتات (57%) أشكالًا جديدة، وأحيانًا خاصة بالأنسجة، لنفس الجينات المعروفة و3% تتعلق بمواقع جينية جديدة. في حالات أخرى، أدت الترنسكريبتات المحددة إلى تحسين نماذج الجينات الحالية. عند حساب المتوسط عبر جميع الأنسجة الست، يتم دعم 90% من نقاط الالتقاء بواسطة قراءات قصيرة من الأنسجة المتطابقة. بالإضافة إلى ذلك، حددنا عددًا كبيرًا من RNAs غير المشفرة الطويلة والترانسكريبتات المدمجة ووجدنا أن ميثيل الحمض النووي يلعب دورًا مهمًا في توليد أشكال مختلفة. تظهر نتائجنا أن توصيف ترانسكريبتوم الذرة B73 بعيد عن الكمال، وأن تعبير الجينات في الذرة أكثر تعقيدًا مما كان يُعتقد سابقًا.