كاتناب: أداة لجمع وتحليل وحساب لوحات الأجسام المضادة المعادلة

كاتناب (جمع، تحليل وحساب لوحات NAb) هو خادم ويب جديد في قاعدة بيانات HIV في لوس ألاموس، تم إنشاؤه للاستجابة لأحدث التطورات في أبحاث الأجسام المضادة المعادلة لفيروس الإيدز. إنها منصة شاملة تركز على قوى الأجسام المضادة المعادلة بالتزامن مع تسلسلات الفيروسات. يجمع كاتناب بيانات المعادلة والتسلسل من الدراسات المنشورة، ويسمح للمستخدمين بتحليل تلك البيانات لكل وضع تسلسل بروتين غلاف فيروس الإيدز ولكل جسم مضاد. تحتوي الأداة على خيارات متعددة للاسترجاع والتحليل البياني. كمدخل، يمكن للمستخدم اختيار أجسام مضادة معينة وفيروسات، اختيار لوحة من دراسة منشورة، أو تزويد بياناتهم الخاصة. ينتج عن المخرجات تداخل بيانات لوحة المعادلة، بيانات وبائيات الفيروس، وتوافق تسلسلات البروتين الفيروسي في صفحة واحدة، ويقدم معلومات وتحليلات إضافية. يمكن للمستخدم تسليط الضوء على مواضع التوافق، أو اختيار بقايا تواصل الجسم المضاد وعرض معلومات محددة عن المواضع من قواعد بيانات HIV. تحسب الأداة عدادات الأحماض الأمينية ومواضيع الجليكيز المرتبطة بـ N، وعدد الفيروسات الحساسة والمقاومة للأجسام المضادة بالتزامن مع كل حمض أميني أو موضوع جليكيز، وتقوم بإجراء اختبار فيشر الدقيق للكشف عن الربط المحتمل الإيجابي أو السلبي للأحماض الأمينية للجسم المضاد المحدد. اسم الموقع: كاتناب (جمع، تحليل وحساب لوحات NAb). عنوان الموقع: http://hiv.lanl.gov/catnap.