Edaphobacter modestus gen. nov. و Edaphobacter aggregans sp. nov.، نوع من الأحياء الدقيقة Acidobacteria المعزولة من التربة الجبلية والغابات

تعتبر شعبة الـ Acidobacteria ممثلة حاليًا بشكل أساسي بواسطة تسلسلات جينات 16S rRNA البيئية، وتحتوي الشعبة حتى الآن على أربعة أنواع فقط بأسماء منشورة بشكل صحيح، وهي Holophaga foetida وGeothrix fermentans وAcidobacterium capsulatum وTerriglobus roseus. في هذه الدراسة، تم عزل سلالتين جديدتين من الأحماض البكتيرية. وتم إعداد تحسينات عالية الإنتاجية باستخدام تقنية MicroDrop باستخدام عينة من تربة كربونية جبلية ومزيج من المركبات الكربونية البوليمرية المضاف إليها مركبات إشارة. أدى هذا النهج إلى الحصول على نوع جديد، وهو الأحماض البكتيرية المعروفة سابقًا، السلالة Jbg-1T. تم استرجاع السلالة الثانية، Wbg-1T، من زراعة مشتركة مع بكتيريا ميثانوغرافية تم إنشاؤها من تربة غابات كربونية. تمثل كلا السلالتين أعضاء في القسم 1 من شعبة الـ Acidobacteria وهما مرتبطتان ارتباطًا وثيقًا مع بعضهما البعض (98.0 % من تشابه تسلسل جين 16S rRNA). عند نسبة تشابه 93.8-94.7 %، تكون السلالتان Jbg-1T وWbg-1T مرتبطة بشكل بعيد عن أقرب قريب موصوف، Terriglobus roseus KBS 63T، وبناءً عليه تم وصفهما كأعضاء في الجنس الجديد Edaphobacter gen. nov. بناءً على العلاقة بين الحمض النووي-الحمض النووي بين السلالتين Jbg-1T وWbg-1T والتي تبلغ 11.5-13.6 % وخصائصهما الكيميائية والظاهراتية، تم تصنيف السلالتين كنوعين منفصلين، Edaphobacter modestus sp. nov. (النمط النوعي)، مع السلالة Jbg-1T (=ATCC BAA-1329T =DSM 18101T) كالسلالة النمطية، وEdaphobacter aggregans sp. nov. مع السلالة Wbg-1T (=ATCC BAA-1497T =DSM 19364T) كالسلالة النمطية. تتكيف الأنواع الجديدة مع تركيزات الكربون المنخفضة وظروف محايدة إلى حموضية قليلاً.