التحقق من صحة خطوط الخلايا البشرية المعتمدة على تعدد الأشكال النوكليوتيدية بسرعة عالية

يبقى استخدام خطوط الخلايا المزيفة مشكلة رئيسية في البحث البيولوجي. يمثل تحليل تكرارات التسلسل القصير (STR) التقنية القياسية الرائدة في التحقق من صحة خطوط الخلايا. ومع ذلك، تتميز خطوط الخلايا التي تعاني من نقص في تصحيح الأخطاء (MMR) بعدم استقرار الميكروساتلايت، مما قد يسبب انزياحات أليلية بالاشتراك مع نمو انتقائي لخطوط فرعية تعيش، وبالتالي، من المحتمل أن يتم تصنيفها بشكل خاطئ من قبل تحليل STR. بناءً على منصة Luminex ذات الإنتاجية العالية، قمنا بتطوير اختبار تحليل تعدد الأشكال النوكليوتيدية المكون من 24 وحدة، والذي يُطلق عليه اسم التحقق من صحة الخلايا المتعددة (MCA)، لتحديد صحة خطوط الخلايا البشرية. تم تقييم MCA من خلال تحليل مجموعة من 436 خط خلية بشرية من المجموعة الألمانية للميكروبات وزراعة الخلايا، التي تم تقييمها سابقًا من خلال تحليل STR لثمانية مواقع. أظهرت كلا الاختبارين درجة عالية جدًا من التوافق واحتمالات مطابقة متشابهة (~1 × 10(-8) لتحليل STR و~1 × 10(-9) لـMCA). سمح MCA بالكشف عن أقل من 3% من خلايا البشر الملوثة. من خلال تحليل خطوط الخلايا التي تعاني من نقص في MMR، تم الحصول على دليل على قوة أكبر لـMCA مقارنةً بتحليل STR. في الختام، يمكن أن يكمل MCA التحقق الروتيني من صحة خطوط الخلايا ويحل محل تقنية STR القياسية في حالة خطوط الخلايا MSI.