هياكل الحلول للهجين DNA·RNA مع خيوط غنية بالبيورين وغنية بالحيوانات المنوية: مقارنة مع الدوكسيس DNA و RNA المتجانسة,

تم تحديد هياكل d(GAAGAGAAGC).d(GCTTCTCTTC) و d(GAAGAGAAGC). r(GCUUCUCUUC) و r(GAAGAGAAGC).d(GCTTCTCTTC) و r(GAAGAGAAGC). r(GCUUCUCUUC) في المحلول استنادًا إلى بيانات NMR. بشكل عام، كانت الدوكسيات النقية من الـ DNA و RNA في الشكل B و A، على التوالي. لم يكن الهجينان DNA.RNA في الشكل A أو B، ولكن كان أقرب بشكل عام إلى الشكل A من B. ومع ذلك، فإن الدوكسيه الأقل استقرارًا من الناحية الديناميكية الحرارية d(GAAGAGAAGC).r(GCUUCUCUUC) لها شكل مختلف بشكل كبير عن r(GAAGAGAAGC). d(GCTTCTCTTC). تم حساب الهياكل استنادًا إلى بيانات NMR، باستخدام الديناميكا الجزيئية المقيدة. تم استخدام نهج جديد لمعالجة التوسيع التوافقي يستند إلى احتمالات أ_prior. تم معالجة النيوكليوتيدات من خلال مطابقة بيانات التزاوج القياسي ووقت NOE لنموذج ذو حالتين يتألف من كل من N و S من تشكل السكر، كل منها بزاوية التواء جليكوسيدية مختلفة، والكسور المولية لحالة S. تم بناء مجموعات القيود لتوزيعات مختلفة من حالات N و S داخل الجزيئات، بحيث تم وزن كل نيوكليوتيد في المجموعة وفقًا للكسور المولية (أو احتمالات أ_prior). تم تقييد التشكيلات الفردية للنيوكليوتيدات بشدة، بينما تم تعيين القيود بين النيوكليوتيدات بشكل نسبي فضفاض. تم إنشاء مجموعات من التشكيلات وتقييمها من خلال مقارنة NOEs المحسوبة من مصفوفات الاسترخاء المتوسطة مع NOEs التجريبية. كانت المتوسطات الجماعية أفضل في تفسير البيانات التجريبية من أي عضو فردي، أو من الهياكل المحسوبة الافتراض بأنها تحتاج إلى شكل توافقي فريد. احتلت الهجينات درجات مختلفة من الفضاء التوافقي. كانت هناك اتجاه عام في عرض العقود الصغيرة والكبيرة بالترتيب: d(GAAGAGAAGC).d(GCTTCTCTTC) و d(GAAGAGAAGC).r(GCUUCUCUUC) و r(GAAGAGAAGC).d(GCTTCTCTTC) و r(GAAGAGAAGC).r(GCUUCUCUUC) وتقدم مشابه في الشخصية العامة من الهياكل الشبيهة بـ B إلى الشبيهة بـ A. علاوة على ذلك، أظهرت r(GAAGAGAAGC).d(GCTTCTCTTC) انتشارًا أكبر من التشكيلات في المجموعة من d(GAAGAGAAGC).r(GCUUCUCUUC)، مما يعكس مرونة أكبر للسكريات. إذا تم تجاهل التوسيع التوافقي للنيوكليوتيدات، يتم إنتاج هياكل افتراضية غير صحيحة لكنها لا تزال قادرة على تلبية نسبة كبيرة من البيانات التجريبية.