Key points are not available for this paper at this time.
TIGRFAMs هي مجموعة من عائلات البروتينات التي تم تنسيقها يدويًا وتتكون من نماذج ماركوف الخفية (HMMs)، محاذاة تسلسلات متعددة، تعليقات، تفويضات علم الجينات (GO)، مراجع أدبية وإشارات إلى نماذج TIGRFAMs وPfam وInterPro ذات الصلة. تم تصميم هذه النماذج لدعم كل من التخصيص الآلي والتخصيص اليدوي للجينومات. تحتوي TIGRFAMs على نماذج للبروتينات الكاملة وأجزاء أقصر على مستويات الأسر العظمى، والأسر الفرعية والمرادفات، حيث تعتبر المرادفات مجموعات من البروتينات المتجانسة المحفوظة بالنسبة لوظائفها منذ السلف المشترك الأخير. يتم تحديد نطاق كل نموذج عن طريق رفع أو خفض الدرجات الحدية واختيار أعضاء محاذاة البذور لتجميع البروتينات التي تشترك في وظيفة محددة (مرادف) أو خصائص أكثر عمومية. الهدف العام هو توفير معلومات ذات أقصى فائدة لعملية التخصيص. وبالتالي، فإن TIGRFAMs تكمل Pfam، التي عادةً ما تحقق تغطية واسعة عبر المتجانسات البعيدة ولكنها تنتهي عند حدود النطاقات الهيكلية المحفوظة. تحتوي قاعدة البيانات حاليًا على أكثر من 1600 عائلة بروتين. TIGRFAMs متاحة للبحث أو التحميل على www.tigr.org/TIGRFAMs.
درس دانيال إتش. هافت (الأربعاء) هذا السؤال.