الهندسة الجينومية تكشف عن مناطق كبيرة يمكن الاستغناء عنها في بكتيريا باسيلاس سوبتيليس

تحتوي الجينومات البكتيرية على 250 إلى 500 جين أساسي، كما تشير إلى ذلك تعطيلات الجينات الفردية والاعتبارات النظرية. إذا كانت هذه الرؤية صحيحة، فإن الجينات غير الأساسية المتبقية من كائن حي، مثل باسيلاس سوبتيليس، قد تم اكتسابها خلال التطور في موائلها البيئية التي تتغير باستمرار. ومن الجدير بالذكر، أن حوالي 47٪ من حوالي 4100 جين في ب. سوبتيليس تنتمي إلى عائلات جينية متشابهة حيث أن العديد من الأعضاء لها وظائف مشتركة. وبالتالي، ستفوق وظائف الجينات الأساسية عدد الجينات الأساسية. للإجابة على السؤال حول إلى أي مدى تساهم الحمض النووي المكتسب حديثًا في حياة ب. سوبتيليس تحت ظروف النمو المخبرية القياسية، بدأنا "إعادة بناء" جينوم ب. سوبتيليس من خلال إزالة البروفيجات والجزر الغنية بالـ AT. أدت الإزالة التدريجية لبروفيجين (SPbeta ،PBSX)، وثلاث مناطق تشبه البروفيج، وأكبر جين مرتب في ب. سوبتيليس (pks) إلى تقليص الجينوم بنسبة 7.7٪ وإزالة 332 جينًا. وتمت caracterization الفينوتي من السلالة الناتجة من خلال تحليل تدفق الأيض، والبروتيوميات، والاختبارات المحددة لافراز البروتين، وتطوير الكفاءة، والتكاثر، والحركة الخلوية. نثبت أن الهندسة الجينومية هي استراتيجية قابلة للتطبيق للتحليل الوظيفي لمجموعات الجينات الكبيرة، وأن إزالة المناطق الجينومية القابلة للاستغناء عنها قد تمهد الطريق نحو مصنع خلايا الباسيلاس المحسن.