تنوع جيني ودراسة ارتباط الجينوم الشامل للخصائص الشكلية والنوعية في الخوخ باستخدام مجموعتين من الجينات الإسبانية للخوخ.

(L.) Batsch] هي واحدة من أهم أنواع الفواكه الحجرية في إنتاج العالم. حاليًا، تعتبر إسبانيا ثاني أكبر منتج للخوخ في العالم، والم cultivars المتاحة في إسبانيا تشمل مصدرًا كبيرًا من التنوع الجيني مع تباين في خصائص جودة الفاكهة وتحمل الاضطرابات بعد الحصاد. لاستكشاف التنوع الجيني وترابط الأنماط الأحادية النوكليوتيد (SNP) في الجينات الإسبانية، تم استخدام مصفوفة الخوخ 18K SNP v2 لتحديد علامات 287 عينة تنتمي إلى مجموعتين قوميتين من جينات الخوخ الموجودة في مركز أبحاث وتكنولوجيا الأغذية في أراغون (CITA) وفي محطة أولا دي (EEAD)-CSIC. سمحت الكثافة العالية للمصفوفة الجديدة من SNP بتحديد 30 مجموعة من التسميات المترادفة، والتي لم يتم تحديدها من قبل باستخدام علامات ذات كثافة منخفضة. بالإضافة إلى ذلك، تم اكتشاف حدث جزيئي محتمل على نطاق واسع في 'Starcrest'، وهو نوع من 'Springcrest'، يظهر احتمال استبدال الكروموسوم في منطقة تبلغ 13.5 ميغابايت. توافق الاقتراحات السابقة حول المناطق التنويعية الإسبانية مع نتائجنا للتنوع الجيني وتدهور الارتباط غير المتوازن (LD) باستخدام علامات ذات كثافة عالية. وكشفت دراسة عن الارتباط الجينومي الشامل (GWAS) عن 34 ارتباطًا مهمًا بين SNP والخصائص لنوع غدد الأوراق (TLG)، وشعرية الفاكهة (FH)، وملمس اللحم (FT). تم دراسة تأثير SNP الهامة باستخدام SnpEff. ترمز الجينات المرشحة إلى العديد من البروتينات الحيوية المهمة المساهمة في تشكيل الشعرات والمقاومة للعفن البودري (مرتبط بـ TLG في الخوخ). توفر المسافة الجينية بين cultivars التي تم الحصول عليها، جنبًا إلى جنب مع ارتباطات SNP-الخصائص التي تم العثور عليها، معرفة جديدة لاختيار المساعدات باستخدام العلامات وطرق التهجين في برامج تربية الخوخ.