التعريف بين الأنواع وفيما بينها لأنواع بارتونيلا (روكاليميا)

تُعتبر أنواع جنس روكاليميا، الذي تم إعادة تسميته مؤخرًا إلى بارتونيلا، من المواضيع الطبية التي تثير اهتمامًا متزايدًا. تم الإبلاغ عن بارتونيلا كوينتانا كسبب لحمّى الخندق، التهاب الشغاف، ووعائيّات دموية باكتيرية. وقد تم ربط ب. هينسيلاي بأعراض والعدوى لمرضى فيروس نقص المناعة البشرية، مثل الحمى، التهاب الشغاف، ووعائيّات دموية باكتيرية، وهو متورط في سبب مرض خدش القطط. إن النطاق الواسع من العدوى يجعل من الضروري الحصول على أداة لتعريف الأنواع ضمن النوع الواحد لإجراء دراسات وبائية. تم دراسة ب. فينسوناي، ب. إليزابيثاي، سبعة عزلات من ب. كوينتانا، وأربع عزلات من ب. هينسيلاي بواسطة تخطيط الهلام الكهربائي بالحقول النبضية (PFGE) بعد التقييد باستخدام الإنزيمات القاطعة بشكل نادر NotI، EagI، وSmaI. تم الحصول على ملفات تعريف محددة لكل من الأنواع الأربعة من بارتونيلا. أظهر مقارنة بصمات الحمض النووي لعزلات من نفس النوع تباينًا في أنماط تقييد الحمض النووي، وتم الحصول على ملف تعريف محدد لكل عزلة. تم الحصول على تحليل سلالة لعزلات ب. كوينتانا باستخدام معامل دييس، UPGMA (طريقة مجموعات غير الموزونة من متوسطات الحساب)، وبرنامج باكيج فيليب. تم إجراء تضخيم بواسطة PCR وتسلسل لاحق باستخدام جهاز تسلسل الحمض النووي بالليزر الأوتوماتيكي (فارماسيكا) على منطقة الفاصل بين الجينات 16 و23S الرنا الريبوزي. وُجد أن كل عزلة من ب. هينسيلاي لها تسلسل محدد، بينما كانت عزلات ب. كوينتانا تنتمي إلى مجموعتين فقط. عندما تم إجراء تحليل تقييد الإنزيمات لعينة ITS من منتج PCR، سمحت ثلاثة إنزيمات، TaqI، HindIII، وHaeIII، بتعريف الأنواع لبارتونيلا spp. قد تكون أشكال تباين طول القطع بعد تضخيم PCR لجين 16S-23S rRNA مفيدة للتعرف السريع على الأنواع، وقد يكون PFGE طريقة فعالة للتعرف على العزلات.