نهج التعلم العميق لكشف السرطان وتحديد الجينات ذات الصلة

لا يزال كشف السرطان من بيانات تعبير الجينات يمثل تحديًا بسبب الأبعاد العالية وتعقيد هذه البيانات. بعد عقود من البحث، لا تزال هناك شكوك في التشخيص السريري للسرطان وتحديد العلامات الخاصة بالأورام. هنا نقدم نهجًا للتعلم العميق لكشف السرطان، ولتحديد الجينات الأساسية لتشخيص سرطان الثدي. أولاً، استخدمنا مشفر الضوضاء المكدس (SDAE) لاستخراج الميزات الوظيفية بعمق من ملفات تعبير الجينات العالية الأبعاد. بعد ذلك، قمنا بتقييم أداء التمثيل المستخرج من خلال نماذج التصنيف المشرف للتحقق من فائدة الميزات الجديدة في كشف السرطان. أخيراً، قمنا بتحديد مجموعة من الجينات التفاعلية بشدة من خلال تحليل مصفوفات الاتصال لـ SDAE. توضح نتائجنا وتحليلنا أن هذه الجينات التفاعلية بشدة يمكن أن تكون علامات بيولوجية للسرطان مفيدة لكشف سرطان الثدي تستحق دراسات إضافية.