استراتيجيات لتسلسل وتحليل الجينوم الميكروبي بالكامل

أدخلت طرق لتحليل تسلسل الحمض النووي آليًا قبل ما يقرب من عقد من الزمان، جنبًا إلى جنب مع التطورات الأكثر حداثة في مجال المعلوماتية الحيوية، وقد أحدثت ثورة في البيولوجيا والطب وفتحت عصرًا جديدًا من العلوم الجينومية، ودراسة الجينات والجينومات. لقد كان لهذه التقنيات الجديدة تأثير على العديد من مجالات البحث، بما في ذلك العلاقة بين الجينات والمرض، في التشخيص القائم على الحمض النووي، وفي تسلسل الجينومات من الإنسان وأعضاء نموذجية أخرى. كانت الدليل في عام 1995 أن طرق تسلسل الحمض النووي الآلي يمكن استخدامها لفك تسلسل الجينوم الكامل لكائن حي حر، هويموفيلوس إنفلوانزا، علامة فارقة في كل من مجالات الجينوميات والميكروبيولوجيا. منذ أول تقرير عن التسلسل الكامل لـ H. influenzae، تم اعتماد هذه المنهجيات من قبل المختبرات في جميع أنحاء العالم. تم الإبلاغ عن التسلسل الجينومي الكامل لخمس أنواع من البكتيريا الحقيقية، واحدة من الآركيا، واليوكاريوتي، Saccharomyces cerevisiae، في الأشهر الثمانية عشر الماضية. في بداية عام 1997، كان هناك أكثر من عشرة مشاريع للجينوم الميكروبي في أو قرب الاكتمال، مع العديد من المشاريع الأخرى قيد التنفيذ. من المحتمل أنه في السنوات القليلة المقبلة سنرى التسلسل الكامل لما قد يصل إلى 30-40 جينوم ميكروبي. في هذه المقالة، سنراجع طرق تسلسل وتحليل الجينوم بالكامل وسنبحث في كيفية استغلال هذه المعلومات لفهم الفيزيولوجيا وال evolución الميكروبية بشكل أفضل.