تتوقف تركيبات الأدوية المتآزرة والمعاكسه على طوبولوجيا الشبكة

قد تظهر تركيبات الأدوية آثارًا متآزرة أو متعارضة. ولا يزال التصميم العقلاني لتركيبات الأدوية المتآزرة يمثل تحديًا على الرغم من الجهود التجريبية والحاسوبية النشطة. نظرًا لأن الأدوية تظهر آثارها عبر أهدافها، فإن تأثيرات تركيبات الأدوية ينبغي أن تعتمد على تفاعل أهدافها بطريقة شبكية. لذلك قمنا بتمثيل آثار تركيبات الأدوية مع تفاعل أهدافها في شبكة، محاولين توضيح العلاقات بين طوبولوجيا الشبكة التي تشمل أهداف الأدوية وتأثيرات تركيبات الأدوية. استخدمنا شبكات إنزيمية من ثلاث عقد مع طوبولوجيات وبارامترات متنوعة لدراسة تركيبات الأدوية ذات الدواءين. يمكن أن تكون هذه الشبكات تبسيطات لشبكات أكثر تعقيدًا تشمل أهداف الأدوية، أو شبكات أهداف مترابطة عن كثب. وجدنا أن تأثيرات معظم التركيبات لم تكن حساسة لتغيرات المعلمات، مما يشير إلى أن تأثيرات تركيبات الأدوية تعتمد إلى حد كبير على طوبولوجيا الشبكة. ثم قمنا بتحديد وتحليل أنماط تركيبات الأدوية المتآزرة أو المتعارضة المتسقة. تشمل الأنماط المتآزرة مجموعة متنوعة من الأنماط، بما في ذلك التركيبات التسلسلية والمتوازية، بينما تكون التركيبات المتعارضة أقل شيوعًا وموحده، تتكون في الغالب من حلقة تغذية راجعة إيجابية ورابط أسفل المسار. بشكل عام، تشير دراستنا إلى أن تصميم تركيبات جديدة من الأدوية المتآزرة بناءً على طوبولوجيا الشبكة يمكن أن يكون واعدًا، وأن الأنماط التي حددناها يمكن أن تكون دليلاً مفيدًا لتصميم تركيبات الأدوية العقلانية في الأنظمة الإنزيمية.