تصوير عالي الدقة للجينوم على مستوى الجينوم في خلايا الإنسان لعوامل النسخ المتنوعة

تحدد تنظيم نسخ الجينات في أنواع الخلايا المختلفة إلى حد كبير من خلال مجموعات متنوعة من العناصر الساكنة حيث ترتبط عوامل النسخ. هنا نوضح أن بيانات من اختبار فرط حساسية DNase I عالي الإنتاجية يمكن أن تحدد مئات الآلاف من بصمات القاعدة بدقة في خلايا الإنسان التي تشير بدقة إلى تفاعلات عوامل النسخ-DNA الفردية. توفر هذه التعليقات مصدراً فريداً للتحقيق في العناصر الساكنة المنظمة. نجد أن بصمات عوامل النسخ المحددة تتوافق مع إثراء ChIP-seq ويمكن أن تحدد بدقة الأنماط الوظيفية مقابل غير الوظيفية لعوامل النسخ. نجد أيضاً أن البصمات تكشف عن نمط فريد من الحفظ التطوري الذي يميز القواعد المدروسة الوظيفية عن الـDNA المحيط. وأخيراً، تشير التحليلات التفصيلية لبصمات CTCF إلى عدة أنماط من الربط ونمط ربط DNA جديد يتواجد upstream لموقع الربط الرئيسي.