ميت فيوجن: تكامل استراتيجيات تحديد المركبات

تعتبر مطيافية الكتلة (MS) تقنية تحليلية مهمة لاكتشاف وتحديد المركبات الصغيرة. تعتبر نقطة الاختناق الرئيسية في تفسير ملف تعريف الأيض أو تجارب الفحص هي تحديد المركبات غير المعروفة من الأطياف الكتلية المزدوجة. تحتوي المكتبات الطيفية لمطيافية الكتلة المزدوجة، مثل MassBank أو NIST، على أطياف مرجعية للعديد من المركبات، لكن تغطيتها الكيميائية المحدودة تقلل من فرصة تحديد موثوق وصحيح للأطياف غير المعروفة خارج نطاق قاعدة البيانات. من ناحية أخرى، تحتوي قواعد بيانات المركبات مثل PubChem أو ChemSpider على تغطية أكبر بكثير للمجال الكيميائي، لكن لا يمكن الاستعلام عنها بمعلومات طيفية مباشرة. مؤخرًا، تسمح أساليب مطيافية الكتلة الحاسوبية وتوقع تكسير المركبات بالبحث في هذه القواعد البيانات للهياكل الكيميائية. نقدم استراتيجية جديدة تسمى ميت فيوجن لدمج نتائج التعرف من عدة موارد، وبشكل خاص، من المفرغ الحاسوبي MetFrag مع المكتبة الطيفية MassBank لتحسين تحديد المركبات. نحن نقوم بتقييم الأداء على مجموعة من 1062 طيفًا ونحقق تصنيفًا محسنًا للمركب الصحيح من المرتبة 28 باستخدام MetFrag وحده، إلى المرتبة 7 مع ميت فيوجن، حتى وإن كانت المركب الصحيح والمركبات المشابهة غائبة عن المكتبة الطيفية. بناءً على التقييم، نستخلص أداء ميت فيوجن إلى قاعدة بيانات المركبات KEGG.