February 26, 2010Open Access
التفسير الجيني للمنطقة تحت منحنى الـ ROC في التحليل الجينومي
Key Points
Key points are not available for this paper at this time.
Abstract
لقد سهلت دراسات الارتباط على مستوى الجينوم في السكان البشريين إنشاء ملفات جينومية تجمع تأثيرات العديد من المتغيرات الجينية المرتبطة للتنبؤ بمخاطر الإصابة بالمرض. تعتبر المنطقة تحت منحنى الخصائص التشغيلية المستقبلية (ROC) مقياساً معترفاً به لتحديد فعالية الاختبارات في تصنيف الأفراد المصابين وغير المصابين بشكل صحيح. نستخدم نظرية الوراثة الكمية لتوفير رؤى حول التفسير الجيني للمنطقة تحت منحنى ROC (AUC) عندما يكون مصنف الاختبار مؤشراً على خطر جيني. حتى عندما تكون نسبة التباين الجيني التي يفسرها الاختبار 100٪، هناك قيمة قصوى لـ AUC تعتمد على الوبائيات الجينية للمرض، أي إما خطر تكرار الأخوة أو الوراثة وانتشار المرض. نستنتج معادلة تربط بين الحد الأقصى لـ AUC والوراثة وانتشار المرض. يمكن عكس التعبير لحساب نسبة التباين الجيني الذي يتم تفسيره بناءً على AUC، وانتشار المرض، والوراثة. نستخدم تقديرات منشورة لانتشار المرض وخطر تكرار الأخوة لـ 17 مرضًا جينيًا معقدًا لحساب نسبة التباين الجيني التي يجب على الاختبار تفسيرها لتحقيق AUC = 0.75؛ وقد تراوحت بين 0.10 و 0.74. نقدم تفسيرًا جينيًا لـ AUC لاستخدامه مع المؤشرات على خطر جيني بناءً على الملفات الجينومية. نقدم استراتيجية لتقدير نسبة التباين الجيني المشروح على مقياس المسؤولية بناءً على تقديرات AUC، وانتشار المرض، والوراثة (أو خطر تكرار الأخوة) المتاحة كآلة حاسبة على الإنترنت.