Key points are not available for this paper at this time.
نتيجة مُجمِّع الجينوم عادةً ما تتكون من مجموعة من تسلسلات الحمض النووي المتجاورة (contigs) التي لا يتم تعريف موضعها النسبي على طول الجينوم. تُستخدم إجراء يسمى الهيكلة عادةً لترتيب وتوجيه هذه التسلسلات باستخدام معلومات القراءة الزوجية. يُعتبر ترتيب التسلسلات خطوة أساسية عند إنهاء وتحليل البيانات من مشروع جينوم شامل باستخدام تقنية السلاحف. معظم المجاميع الحديثة تشمل وحدة هيكلة؛ ومع ذلك، فإن لدى المستخدمين تحكمًا قليلًا في خوارزمية الهيكلة أو المعلومات المنتجة. ولذلك، قمنا بتطوير مُهيكل عام، يُدعى بامبوس، والذي يمنح المستخدمين مرونة كبيرة في التحكم في معلمات الهيكلة. تم استخدام بامبوس مؤخرًا لهيكلة بيانات جينوم الكلب ذات التغطية المنخفضة. والأهم من ذلك، يمكّن بامبوس من استخدام بيانات الربط غير المستنتجة من معلومات الزوجين. على سبيل المثال، يمكن استخدام تسلسل الجينوم المكتمل لتوجيه هيكلة كائن ذي صلة. نقدم عدة تطبيقات لبامبوس: الدعم في إنهاء المشاريع، علم الجينوم المقارن، تحليل هيكل الهابلوتيب للجينومات، وتهيئة جينوم الثدييات بتغطية منخفضة. بامبوس متاح كحزمة مفتوحة المصدر من موقعنا على الإنترنت.
دراسة Pop وآخرون (الخميس) هذا السؤال.