Key points are not available for this paper at this time.
يعتمد استغلال الميتاجينوم للحصول على محفزات حيوية جديدة من خلال الفحص الوظيفي على القدرة على التعبير عن الجينات المعنية في مضيف بديل. تعتمد احتمالية استرجاع جين معين على وفرة هذا الجين في الحمض النووي البيئي المستخدم لبناء المكتبة، وحجم الإدخال المختار، وطول الجين المستهدف، ووجود إشارات تعبير وظيفية في الكائن الحي المضيف. في هذه الورقة، نقدم مجموعة من الصيغ التي تصف فرصة عزل جين من خلال الاستنساخ العشوائي، مع الأخذ في الاعتبار أنماط التعبير الجيني المختلفة: التعبير المستقل، التعبير كدمج نسخي، والتعبير كدمج ترجمى. تظهر الجينات من الفئة الأخيرة أنها غير قابلة للوصول عملياً من خلال الاستنساخ العشوائي بسبب التردد المنخفض للبنى الوظيفية. لتقييم أي جزء من الميتاجينوم قد يتجنب الاستغلال بهذا الشكل، تم تحليل 32 تسلسل جينومي كامل لكائنات بدائية النواة لوجود إشارات تعبير فعالة في مضيفات E. coli، باستخدام أدوات المعلومات الحيوية. تكشف دراستنا عن اختلافات كبيرة في أنماط التعبير المتوقعة بين مجموعات تصنيفية متميزة من الكائنات الحية وتقترح أن حوالي 40% من الأنشطة الإنزيمية قد تُسترجع بسهولة من خلال الاستنساخ العشوائي في E. coli.
درس غابور وآخرون (الأربعاء) هذا السؤال.