تحديد استراتيجيات وتوقع التداخل الدوائي بناءً على التشابه الوظيفي للأهداف

يمكن أن توسع تركيبات الأدوية الخيارات العلاجية وتعالج مقاومة السرطان. ومع ذلك، فإن مساحة التركيبات كبيرة جداً مما يمنع استكشافها بطريقة منهجية. لذلك، فإن استراتيجيات توقع التداخل الدوائي ضرورية. هنا نقدم طريقة لتحديد أولويات تركيبات الأدوية في الفحوصات عالية الإنتاجية ولتصنيف الاستجابات التداخلية. في جوهر نهجنا، يتمثل الملاحظة في أن احتمال التداخل يزداد عند استهداف البروتينات ذات التشابه الوظيفي القوي أو عدم التشابه. نحن نقوم بتقدير التشابه باستخدام نهج تعلم آلة متعدد المهام على التعبير الجيني الأساسي والاستجابة للأدوية الفردية. اختبرنا 7 أزواج من أهداف البروتين (تمثل 29 تركيبة) وتوقعنا تدخلاتهم في 33 خط خلية لسرطان الثدي. بالإضافة إلى ذلك، قمنا بالتحقق تجريبيًا من التداخل المتوقع لمجموعة BRAF/مستقبل الأنسولين (Dabrafenib/BMS-754807) في 48 خط خلية لسرطان القولون. نتوقع أن يمكن استخدام نهجنا لتحديد أولويات تركيبات الأدوية في الفحوصات واسعة النطاق، ولزيادة فعالية الأدوية المعروفة بالفعل بأنها تسبب التداخل، مما يتيح في النهاية تصنيف المرضى.