Key points are not available for this paper at this time.
الملخص يلعب تجميع الجينوم المرجعي البشري دورًا مركزيًا في جميع جوانب البحث الأساسي والسريري اليوم. يُعد GRCh38 هو التحديث الأول لتغيير الإحداثيات منذ عام 2009 ويعكس حل حوالي 1000 مشكلة ويشمل تعديلات تتراوح بين الآلاف من التغييرات الفردية في القواعد إلى إعادة تنظيم المسارات على نطاق ميغابايت، وإغلاق الفجوات، وتحديد مواقع التسلسلات التي كانت يتيمة سابقًا. لقد طورنا نهجًا جديدًا لتوليد التسلسل لتحديثات القاعدة المستهدفة واستخدمنا بيانات من تقنيات رسم الخرائط الجينومية الجديدة وموارد الهاليبوتيب المفردة لتحديد وحل مشاكل التجميع الأكبر. لأول مرة، يحتوي التجميع المرجعي على تمثيلات قائمة على التسلسل للوسطيات. كما قمنا بتوسيع عدد المواقع البديلة لإنشاء مرجع يوفر تمثيلاً أكثر موثوقية لتباين السكان البشريين. نثبت أن التحديثات تجعل المرجع قاعدة بيانات تحسين التعليق، وتغير محاذاة القراءة في المناطق غير المتغيرة وتؤثر على تفسير المتغيرات في المواقع ذات الأهمية السريرية. كما قمنا بتقييم مجموعة من تجميعات الهاليبوتيب الطويلة الجديدة de novo وخلصنا إلى أنه رغم أن التجميعات الجديدة تقارن بشكل إيجابي مع المرجع فيما يتعلق بالاستمرارية، ومعدل الخطأ، واكتمال الجينات، إلا أن المرجع لا يزال يقدم أفضل تمثيل للمناطق الجينومية المعقدة والتسلسلات المشفرة. نؤكد أن التحديثات المجمعة في GRCh38 تجعل التجميع الأحدث قاعدة بيانات أكثر موثوقية للتحليلات الشاملة التي ستعزز فهمنا للبيولوجيا البشرية وتقدم جهودنا لتحسين الصحة.
درس شنايدر وزملاؤه (Mon,) هذا السؤال.