تشخيص التهاب الدماغ باستخدام علوم الميتاجينوم: تطبيق تسلسل الجيل القادم لحالات غير مشخصة

الخلفية: تشير التقديرات الحالية إلى أنه حتى في أكثر البيئات تجهيزاً، يتم تحديد مسببات التهاب الدماغ في أقل من نصف الحالات السريرية. من المتعارف عليه أن سد هذه الفجوة يحتاج إلى مزيج من أخذ عينات دقيقة وتحسين تقنيات التشخيص. تعتبر طرق تسلسل الجيل القادم (NGS) أدوات قوية تتمتع بإمكانية الكشف الشامل وغير المتحيز عن الجراثيم في العينات السريرية. قمنا بمراجعة استخدام هذه التقنية الجديدة لتشخيص التهاب الدماغ المعدي المشتبه به، وناقشنا الجدوى لتقديم طرق NGS كاختبار تشخيصي أساسي. الطرق: تم إجراء مراجعة منهجية للأدبيات، باستخدام بحث MESH وكلمات نصية عن المتغيرات "التسلسل" و "التهاب الدماغ" في Medline وEMbase، والبحث في المراجع والاستشهادات باستخدام قاعدة بيانات Web of Science. راجع مؤلفان البيانات بشكل مستقل واستخلصاها وعملا على تلخيصها. النتائج: حددت المراجعة 25 مقالًا تسجل 44 تقرير حالة لمرضى يشتبه في إصابتهم بالتهاب الدماغ وتم استخدام NGS كأداة تشخيصية. نحن نقدم البيانات ونسلط الضوء على الموضوعات التي تنشأ من هذه الحالات. لا توجد تجارب محكومة عشوائيًا لتقييم فائدة NGS كأداة تشخيصية. التفسير: هناك أدلة متزايدة على دور NGS في معالجة التهاب الدماغ غير المشخص. ستساعد التكاليف المنخفضة وزيادة إمكانية الوصول لهذه التقنيات على تسهيل دراسات أكبر لهؤلاء المرضى. نوصي بأن يتم اعتبار NGS كاختبار تشخيصي أساسي في حالات التقديم المزمنة والمتكررة، ونظراً لأوقات التحويل الحالية من عينة إلى نتيجة، كاختبار ثانوي في حالات التهاب الدماغ الحادة.