Key points are not available for this paper at this time.
الخلفية: تعتبر مجموعة من السلاسل الكاملة من cDNA موردًا مهمًا لكل من دراسات الجينومات الوظيفية ولتحديد بنية الإنترونات-exon للجينات. لقد كان تقديم هذا المورد إلى مجتمع بحث ذبابة الفاكهة الميلانوجاستر هدفًا طويل الأمد لمشروع جينوم ذبابة الفاكهة في بيركلي. لقد وصفنا سابقًا مجموعة جينات ذبابة الفاكهة (DGC)، وهي مجموعة من cDNA المفترضة كاملة الطول التي تم إنتاجها من خلال توليد وتحليل أكثر من 250,000 علامة تسلسل معبر (EST) مستمدة من مجموعة متنوعة من الأنسجة والمراحل التنموية. النتائج: لقد قمنا بإنتاج تسلسل كامل عالي الجودة لـ 8,921 مستنسخ في DGC. قمنا بمقارنة تسلسل هذه المستنسخات مع التسلسل الجينومي المعلق للإصدار 3، وحددنا أكثر من 5,300 cDNA تحتوي على تسلسل ترميز بروتين كامل ودقيق. وهذا يتوافق مع نموذج واحد على الأقل من أشكال الاقتران لنسبة 40% من الجينات المتوقعة لـ D. melanogaster. كما حددنا أيضًا حالات محتملة جديدة لتحرير RNA. الاستنتاجات: نوضح أن مقارنة تسلسلات cDNA مع تسلسل جينومي معلق عالي الجودة هي نهج فعال لتحديد واستبعاد المستنسخات المعيبة من مجموعة cDNA وضمان فائدتها للتجريب. تم استبعاد المستنسخات إما لأنها تحمل اختلافات في النيوكليوتيدات الفردية، والتي من المحتمل أن تكون ناتجة عن أخطاء في النسخ العكسي، أو لأنها مقطوعة وتحتوي فقط على جزء من تسلسل ترميز البروتين.
درس ستايلتون وآخرون (Mon ،) هذه المسألة.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: